دوره 9، شماره 21 - ( بهار 1396 )
جلد 9 شماره 21 صفحات 107-100 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
(2017). Correlation Analysis of Specific Markers Linked to Flowering Time in Barley (Hordeum vulgare L.)
. J Crop Breed. 9(21), 100-107. doi:10.29252/jcb.9.21.100
URL: http://jcb.sanru.ac.ir/article-1-800-fa.html
URL: http://jcb.sanru.ac.ir/article-1-800-fa.html
رستمی زینب، فاضلی آرش، براری مهرشاد. تجزیه همبستگی نشانگرهای اختصاصی مرتبط با زمان گلدهی در جو پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی 1396; 9 (21) :107-100 10.29252/jcb.9.21.100
چکیده: (4621 مشاهده)
به منظور شناسایی رابطهی نشانگرهای طول روز موثر بر زمان گلدهی در گیاه جو و چهار ژن اختصاصی
(FT4, FT3, FT2, Ppd-H1)، 26 ژنوتیپ و رقم جو زراعی و وحشی در دو شرایط مزرعه و گلخانه مورد مطالعه قرار گرفتند. گیاهان در هر دو شرایط کشت شده و صفت فنولوژیک روز تا 50 در صد گلدهی در هر دو شرایط یادداشت برداری شد. علاوه بر این، 11 صفت مورفولوژی نیز جداگانه در شرایط گلخانه اندازهگیری شد. ارتباط صفت با مارکر نشان داد که ژن Ppd-H1 بیشترین همبستگی منفی و معنیدار با صفت روز تا گلدهی را در هر دو شرایط داشته است که بیانگر این است که آلل غالب Ppd-H1 موجب کاهش تعداد روز تا گلدهی تحت شرایط روز بلندی میشود. نشانگرهایی که به طور معنیدار با صفت روز تا گلدهی مرتبط بودند در تجزیه رگرسیون مورد استفاده قرار گرفتند که بر اساس آن، بیشترین تغییرات توسط نشانگر Ppd-H1 در هر دو شرایط توجیه شد و این بیانگر نقش عمده این ژن در بروز تغییرات تعداد روز تا گلدهی میباشد. در نهایت، ژنوتیپهای زودرس با آلل غالب Ppd-H1 به عنوان بهترین ژنوتیپها برای استفاده در برنامههای اصلاحی و مناطق با فصول رشدی کوتاه و تنشهای محیطی انتهایی معرفی میشوند.
(FT4, FT3, FT2, Ppd-H1)، 26 ژنوتیپ و رقم جو زراعی و وحشی در دو شرایط مزرعه و گلخانه مورد مطالعه قرار گرفتند. گیاهان در هر دو شرایط کشت شده و صفت فنولوژیک روز تا 50 در صد گلدهی در هر دو شرایط یادداشت برداری شد. علاوه بر این، 11 صفت مورفولوژی نیز جداگانه در شرایط گلخانه اندازهگیری شد. ارتباط صفت با مارکر نشان داد که ژن Ppd-H1 بیشترین همبستگی منفی و معنیدار با صفت روز تا گلدهی را در هر دو شرایط داشته است که بیانگر این است که آلل غالب Ppd-H1 موجب کاهش تعداد روز تا گلدهی تحت شرایط روز بلندی میشود. نشانگرهایی که به طور معنیدار با صفت روز تا گلدهی مرتبط بودند در تجزیه رگرسیون مورد استفاده قرار گرفتند که بر اساس آن، بیشترین تغییرات توسط نشانگر Ppd-H1 در هر دو شرایط توجیه شد و این بیانگر نقش عمده این ژن در بروز تغییرات تعداد روز تا گلدهی میباشد. در نهایت، ژنوتیپهای زودرس با آلل غالب Ppd-H1 به عنوان بهترین ژنوتیپها برای استفاده در برنامههای اصلاحی و مناطق با فصول رشدی کوتاه و تنشهای محیطی انتهایی معرفی میشوند.
فهرست منابع
1. Baurle, I. and C. Dean. 2006. The timing of developmental transitions in plants. Journal of cell, 4: 655-664. [DOI:10.1016/j.cell.2006.05.005]
2. Erixon, P. and B. Oxelman. 2008. Whole-gene positive selection, elevated synonymous substitution rates, duplication, and indel evolution of the chloroplast clpP1 gene. PLoS ONE, Journal of Pone, 86-113 pp. [DOI:10.1371/journal.pone.0001386]
3. Faure, S., J. Higgins, A. Turner and D.A. Laurie. 2007. The FLOWERING LOCUS T-like gene family in barley (Hordeum vulgare). Journal of Genetics, 1: 599-609. [DOI:10.1534/genetics.106.069500]
4. Fisher, R.A. and R. Maurer. 1978. Drought resistance in spring wheat cultivars I. Grain yield responses. Journal of Agricultural Research, 5: 897-912. [DOI:10.1071/AR9780897]
5. Griffiths, J.F., J.H. Miller, D.T. Suzuki, R.C. Lewontin and W.M. Gelbert. 1996. An Introduction to Genetic Analysis. 7th eden. Freeman W.H, 800 pp.
6. Gougerdchi, V., S. Dezhsetan, M. Izadi Dogonchi, M.A. Ebrahimi, A. Asghari and B. Sadeghzadeh. 2017. Assessment of Genetic Diversity and Association Analysis for Phonological Traits Related to Drought Escape in Barley Lines using Microsatellite Markers, 8: 60-69 (In Persian).
7. Jones, H., F.J. Leigh, I. Mackay, M.A. Bower, L.M.J. Smith, M.P. Charles, G. Jones, M.K. Jones, T.A. Brown and W. Powell. 2008. Population-Based Resequencing Reveals That the Flowering Time Adaptation of Cultivated Barley Originated East of the Fertile Crescent. Journal of Molecular Biology and Evolution, 10: 2211-19. [DOI:10.1093/molbev/msn167]
8. Kikuchi, R., H. Kawahigashi, T. Ando, T. Tonooka and H. Handa. 2009. Molecular and Functional Characterization of PEBP Genes in Barley Reveal the Diversification of Their Roles in Flowering. Journal of Plant Physiology, 3: 1341-1353. [DOI:10.1104/pp.108.132134]
9. Laurie, D.A., N. Prachett, J.H. Bezant and J.W. Snape. 1995. RFLP mapping of five major genes and eight quantitative trait loci controlling flowering time in a winter 9 spring barley (Hordeum vulgare L.) cross. Journal of Genome, 3: 575-585. [DOI:10.1139/g95-074]
10. Lee, S. 2012. Converting SNPs to CAPS and CAPS and Dcaps marker. Dept, of Horticulture and Crop Science, 32-59 pp.
11. Nakhaeei Badrabad, M., M. Shokrpour, A. Asghari and A.O. Esfandyari. 2012. Determining Relationships among Dry Matter Remobilization and Some Morphological Traits in Barley Genotypes Using Factor Analysis Metho under Low Water Stress. Journal of Crop Breeding, 4: 109-122 (In Persian).
12. Shaaf, S., M.H. Bihamta, A. Talei, V.A. Moohamadi and B. Kilian. 2012. Association analysis of single nucleotide variation in flowering time genes Ppd-H1, HvCO1, HvGI, in barley (H. vulgar). Journal of Novin Genetic, 2: 179-191 (In Persian).
13. Thiel, T., R. Kota, I. Grosse, N. Stein and A. Graner. 2004. SNP2CAPS: a SNP and INDEL analysis tool for CAPS marker development. Journal of Oxford, 1: 5 pp. [DOI:10.1093/nar/gnh006]
14. Turner, A., J. Beales, S. Faure, R.P. Dunford and D.A. Laurie. 2005. The pseudo-response regulator Ppd-H1 provides adaptation to photoperiod in barley. Journal of Science, 57: 1031-1034. [DOI:10.1126/science.1117619]
15. Väli, U., M. Brandström, M. Johansson and H. Ellegren. 2008. Insertion-deletion polymorphisms (indels) as genetic markers in natural populations. Journal of BMC Genet, 8: 1471-2156. [DOI:10.1186/1471-2156-9-8]
16. Wang, G., I. Schmalenbach, M.V. Korff, J. Le'on, B. Kilian, J. Rode and K. Pillen. 2010. Association of barley photoperiod and vernalization genes with QTLs for flowering time and agronomic traits in a BC2DH population and a set of wild barley introgression lines. Theoretical and Applied Genetics, 8: 1559-1574. [DOI:10.1007/s00122-010-1276-y]
17. Zlotina, M.M., O.N. Kovaleva, I.G. Loskutov and E.K. Potokina. 2013. The Use of Allele Specific Markers of the Ppd and Vrn Genes for Predicting Growing Season Duration in Barley Cultivars. Russian Journal of Genetics, 4: 254-264. [DOI:10.1134/S2079059713040114]
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
