دوره 13، شماره 37 - ( بهار 1400 )
جلد 13 شماره 37 صفحات 10-1 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
torkaman S, sofaliyan O, zare N, hasaniyan S. (2021). Investigation of Genetic Diversity of Native Ecotypes of Northwestern Medicinal Plant Mentha longifolia using ISSR Molecular Markers. J Crop Breed. 13(37), 1-10. doi:10.52547/jcb.13.37.1
URL: http://jcb.sanru.ac.ir/article-1-1160-fa.html
URL: http://jcb.sanru.ac.ir/article-1-1160-fa.html
ترکمان سودا، سفالیان امید، زارع ناصر، حسنیان سمیرا. بررسی تنوع ژنتیکی اکوتیپ‌های بومی شمال غرب گیاه دارویی پونه با استفاده از نشانگرهای مولکولی ISSR پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی 1400; 13 (37) :10-1 10.52547/jcb.13.37.1
سودا ترکمان*1، امید سفالیان2، ناصر زارع1، سمیرا حسنیان1
1- گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه محقق اردبیلی
2- زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه محقق اردبیلی
2- زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه محقق اردبیلی
چکیده: (3185 مشاهده)
پونه به‌عنوان یکی از گیاهان دارویی مهم ایران به خانواده نعناعیان متعلق است. با توجه به خواص دارویی متعدد و بسیار مفید پونه، این گیاه موردتوجه بسیاری از مطالعات قرار می‌گیرد. در این بررسی 11 اکوتیپ مختلف پونه از گونه Mentha longifolia متعلق به 11 منطقه مختلف ایران شامل آذربایجان غربی، یزد، گیلان، چهارمحال بختیاری، خوزستان، لرستان، کرمان، هرمزگان، خراسان، قزوین و اردبیل جمع‌آوری و موردمطالعه قرار گرفت. به‌منظور بررسی تنوع ژنتیکی بین اکوتیپ‌های پونه در دانشگاه محقق اردبیلی، آزمایشی در قالب طرح بلوک کاملاً تصادفی در 11 اکوتیپ (تیمار) و 3 تکرار اجرا شد. DNA استخراج و با استفاده از 23 آغازگر گوناگون ISSR موردبررسی قرار گرفت. نتایج حاصل بیانگر وجود پلی-مورفیسم (چندشکلی) کافی در بین این اکوتیپ‌ها است. درمجموع 60 نوار واضح و قابل امتیازدهی تولید گردید، که 60 نوار آن چند شکل هستند. دو نشانگر P9 وp8 بر اساس شاخصهای تنوع ژنتیکی شانون، تنوع ژنی نی و محتوی اطلاعات چندشکلی به ترتیب بالاترین و کمترین مقدار تنوع بین ارقام را نشان دادند همچنین این دو نشانگر به ترتیب بالاترین و کمترین میزان تعداد آلل مؤثر را دارا بودند.در ضمن بر اساس شاخص شانون و نی دو جمعیت کرمان و یزد به ترتیب دارای بالاترین و کمترین مقدار این دو صفت بودند. همین‌طور بر اساس فاصله ژنتیکی نی فاصله ژنتیکی بین اکوتیپ‌ها از 0/285 بین اکوتیپ‌های کرمان و قزوین تا 0/672 بین اکوتیپ‌های هرمزگان و کرمان تا 0/652 بین اکوتیپ‌های یزد و قزوین متغیر هست. گروه‌بندی که بر اساس ماتریس تشابه نشانگرهای ISSR صورت می‌پذیرد، اکوتیپ‌ها را به 3 گروه تقسیم‌بندی می‌کند. در PCA دو مؤلفه اول بیش از 56 درصد واریانس را توجیه کرد. وجود تنوع ژنتیکی بین اکوتیپ‌های پونه امکان انجام مقاصد گزینش را فراهم خواهد کرد.
فهرست منابع
1. Altintas, S., F. Toklu, S. Kafkas, B. Kilian, A. Brandolini and H.O. Zkan. 2008. Estimating genetic diversity in durum and bread wheat cultivars from Turkey using AFLP and SAMPL markers. Plant Breeding, 127: 9-14. [DOI:10.1111/j.1439-0523.2007.01424.x]
2. Amiri, P., A. Ismaili and J. Hadian. 2017. Investigation of genetic diversity of squash eggplant populations (Cucurbita pepo var. Styriaaca) using ISSR molecular markers, Plant Genetics Research, 2: 17-28 (In Persian). [DOI:10.29252/pgr.4.2.17]
3. Bot, J.L. 2009. An update of the Angiosperm phylogeny Group classification for the orders and families of flowering plants. Angiosperm Phylogeny Group, 161: 105-121. [DOI:10.1111/j.1095-8339.2009.00996.x]
4. Craig, J.W. 1999. Health-promoting properties of common herbs. American Journal Clinical Nutrition, 70: 491-499. [DOI:10.1093/ajcn/70.3.491s]
5. Ebrahimi, M.A., M. Tohidfar, M. Karimi and F. Zawarei. 2015. Determination of genetic uniformity in transgenic cotton plants using DNA markers (RAPD and ISSR) and SDS-PAGE. Journal of Plant Molecular Breeding, 3(2): 36-43.
6. Ebrahimpour, M. 2015. Fabrication and characterization of bilayer nanoparticles made of non-ionic surfactant containing black cumin essential oil, Master Thesis in Biology, M.Sc Payame Noor University, Taft Center, Yazd, 56 (In Persian).
7. Esfandiari, S., M. Farshadfar, H. Safari, H. Shirvani and S. Esfandiar. 2017. Investigation of genetic diversity of( Teucrium polium) ecotypes using ISSR molecular marker. Journal of Genetic Research and Breeding Iranian Range and Forest Plants, 1: 135-147 (In Persian).
8. Ganjkhanlu, A., A. Talei, P. Moradi and M. yekdast. 2017. Evaluation of Genetic Diversity of (Silybum marianum L.) Using ISSR Markers, Iranian Crop Science, 4: 1115-1124 (In Persian).
9. Kameli, M., S.M. Hesamzadeh Hejazi and M. Ebadi. 2013. Assessment of genetic diversity on populations of three Satureja species in Iran using ISSR markers. Scholars Research Library, 4: 64-72.
10. Kang, M.J., S. Sundan, G.A. Lee, H.C. Ko, J.W. Chung, Y.C, Huh and et al. 2013. Genetic diversity and population structure of Korean mint agastache rugosa (Fisch and Meyer) Kuntze (Lamiaceae) Using ISSR Markers. Korean Journal of Plant Resources, 26(3): 362-369. [DOI:10.7732/kjpr.2013.26.3.362]
11. Khodadoost, A., H. Yousefzadeh, N. Amirchakhmaqi, H. Abdollahi and A. Hosseinzadeh Kolagar. 2016. Genetic diversity of eastern apple (Malus orientalis Uglitz) Hyrcanian forest of Iran, using ISSR- PCR molecular markers, Journal of Cellular and Molecular Research, 4: 359-369 (In Persian).
12. Mojarad Ashna Abad, M., S. Hosseini, A. Sanbali and R. Heidari. 2018. Study of genetic diversity of the population of the species (Tanacetum polycephalum) of West Azerbaijan using ISSR molecular marker, two journals of genetic research and breeding Range and forest plants of Iran, 2: 268-278 (In Persian).
13. Mohammadi Alagoz, R., R. Darvishzadeh, A. Alijanpour, H. Hatami Maleki and R. Heidari. 2018. Investigation of genetic diversity of different populations of Iranian Sumac (Rhus cariaria L.) using ISSR marker, two scientific-research quarterly journals of genetic research and breeding of rangeland and forest plants in Iran, 2: 196-206 (In Persian).
14. Mohammadi, A. and B.M. Prasanna. 2003. Analysis of genetic diversity in crop plants. Crop Science, 43:48-1235. [DOI:10.2135/cropsci2003.1235]
15. Nei, M. 1972. Genetic distance between population. The American Naturalist, 106(646): 283-292. [DOI:10.1086/282771]
16. Nikkerdar, F., M. Farshadfar, M.A. Ebrahimi and H. SHirvani. 2018. Genetic Diversity among Fennel (Fueniculum Vulgare Mill.) Landrace using Scot Markers. Journal of Crop Breeding, 9(24): 95-102 (In Persian). [DOI:10.29252/jcb.9.24.95]
17. Peakall, R. and P.E. Smouse. 2006. GenAlEx 6: genetic analysis in Excel.Population genetic software for teaching and research. Molecular Ecology Notes, 6: 288-295. [DOI:10.1111/j.1471-8286.2005.01155.x]
18. Rahmati, H. and H. Shirvani. 2018. Investigation of genetic diversity of Dactylis glumerata ecotypes using ISSR molecular markers, Journal of Cellular and Molecular Research, 1: 67-78 (In Persian).
19. Rohlf, F.J. 1993. NTSYS-PC: Numerical taxonomy and multivariate analysissystem, Version 1.8, Exeter Software, Setauket, (Applied Biostatistics Inc., New York).
20. Saeidi, S., K. Hassanpour, M. Ghamgosha, M. Heiat, Taheri and R.A. Mirhosseini. 2014. Antibacterial activity of ethyl acetate and aqueous extracts of (Mentha longifolia L.) and hydroalcoholic extract of (Zataria multiflora Boiss) plants against important human pathogens. Asian Pacific Journal of Tropical Biomedicine, 4(12): 972-975. [DOI:10.1016/S1995-7645(14)60229-7]
21. Sanam Safaei Chaeikar, S., M. Rahimi and SH. Khaghani. 2019. Identification of ISSR and RAPD Molecular Markers Associated with Agronomic Traits in Lemon Balm (Melissa Officinalis). Journal of Crop Breeding, 10(28): 64-72 (In Persian). [DOI:10.29252/jcb.10.28.64]
22. Saghai-Maroof, M.A., K. Soliman, R.A. Jorgensen and R.W. Allard.1984. Ribosomal DNA spacer-length polymorphisms in barley: Mendelian inheritance, chromosome location and population dynamics. Proceeding of the National Academy of Sciences USA, 81: 8014-8018. [DOI:10.1073/pnas.81.24.8014]
23. Shah Ghobadiyev, H., N. Shabanian, A. Khadivi and M. Rahmani. 2018, Study of genetic diversity of pistachio populations (Pistacia atlantica Desf) In Zagros forests based on molecular markers ISSR, IRAP and SCoT, Journal of Genetic Research and Breeding of Range and Forest Plants of Iran, 2: 177-195 (In Persian(.
24. Shannon, C.E. 1948. A mathematiacal theory of communication. AT and T Technical Journal, 27: 379-423. [DOI:10.1002/j.1538-7305.1948.tb01338.x]
25. Simmons, M.P., L.B. Zhang, C.T. Webb and K. Muller. 2006. A penalty of using anonymous dominant markers (AFLPs, ISSRs, and RAPDs) for phylogenetic inference. Molecular Phylogenetics and Evolution. In press. [DOI:10.1016/j.ympev.2006.08.008]
26. Timmappaiah, W., G. Santhosh, D. Shobha and G.S. Melwyn. 2008. Assessment of genetic diversity analysis of Mediterranean faba bean (Vicia faba L.) with ISSR marker. Field Crops Research, 108: 1-7. [DOI:10.1016/j.fcr.2008.02.015]
27. Virk, P.S., J. Zhu, H.J. Newbury, G.J. Bryan, M.T. Jackson and B.V. Ford-lloyd. 2000. Effectiveness of different classes of molecular marker for classifying and revealing variation in rice (Oryza sativa) germplasm. Euphytica, 112: 284-275. [DOI:10.1023/A:1003952720758]
28. Zhao, W., Y. Wang, T. Chen, G. Jia, X. Wang, J. Qi and et al. 2007. Genetic structure of mulberry from different ecotypes revealed by ISSRs in china: An implications for conservation of local mulberry varieties. Sientia Horticulturae, 115(1): 47-55. [DOI:10.1016/j.scienta.2007.07.017]
29. Zhu, Y., J.E. Strassmann and D.C. Queller. 2002. Insertion, substitution and the origin of microsatellite. Genetics Research-Cambridge Core, 76: 236-227. [DOI:10.1017/S001667230000478X]
30. Zinodini, A., M. Farshadfar, H. Safari, F. Moradi and H. Shirvani. 2013. Study of genetic relationships of some mint species using ISSR markers. Crop Biotechnology, 5: 11-21.
ارسال پیام به نویسنده مسئول
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
