دوره 9، شماره 24 - ( زمستان 1396 )                   جلد 9 شماره 24 صفحات 164-158 | برگشت به فهرست نسخه ها


XML English Abstract Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Ebadi A A, Allah gholipoor M, Sharafi N. (2018). Analysis of Quantitative Trait Loci for Ratooning Ability in Rils Population of Rice. jcb. 9(24), 158-164. doi:10.29252/jcb.9.24.158
URL: http://jcb.sanru.ac.ir/article-1-932-fa.html
عبادی علی اکبر، اله‌قلی‌پور مهرزاد، شرفی ناصر. مکان یابی ژن‌های کنترل کننده صفات کمی (QTLs) پیوسته با خصوصیات راتون‌زایی در برنج پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی 1396; 9 (24) :164-158 10.29252/jcb.9.24.158

URL: http://jcb.sanru.ac.ir/article-1-932-fa.html


سازمان تحقیقات آموزش و ‌ترویج کشاورزی رشت
چکیده:   (3726 مشاهده)
در گیاهان گرامینه پنجه‌زدن و تولید ساقه‌های ثانویه در صورت موجود بودن مواد غذائی و درجه حرارت مناسب یک صفت دائمی به­حساب می‌آید. راتونینگ یا عملیات وارویش به­صورت حفظ گیاه جهت رشد در فصل بعدی تعریف می‌گردد. در این تحقیق، به­منظور شناسایی QTL های کنترل‌کننده صفات مرتبط با قابلیت راتون‌زایی از 80 لاین خویش‌آمیخته نوترکیب حاصل از تلاقی دو رقم هاشمی و نعمت استفاده شد. برای بررسی چند شکلی بین والدین از تعداد 500 نشانگر ریزماهواره استفاده شد که از این تعداد، 177 نشانگر چند شکل بودند که برای تهیه نقشه پیوستگی جمعیت روی لاین‌های خویش آمیخته نوترکیب مورد بررسی قرار گرفتند. نقشه پیوستگی بر اساس 170 نشانگر ریزماهواره ترسیم شد که 1590سانتی‌مورگان از ژنوم برنج را پوشش داد و فاصله متوسط بین نشانگرهای مجاور3/9 سانتی‌مورگان بود.‏ در مجموع چهارده QTL بر اساس روش مکان‌یابی فاصله‌ای مرکب فراگیر برای صفات تعداد خوشه بارور، وزن صددانه، باروری خوشه و عملکرد دانه راتون روی کروموزوم‌های 1، 3، 5، 6، 7 ، 8 و 11 شناسایی شدند. مقدار واریانس توجیهی توسط QTL های شناسایی شده برای صفات مورد ارزیابی از 69/7 تا 12/25 متغیر بود. برای هر کدام از صفات تعداد خوشه، وزن صد دانه و باروری خوشه در راتون یک QTL بزرگ اثر روی کروموزوم 1 به‌نام‌های qpfr1، qgwr1 و qfpr1 ‏ به­ترتیب ‏ با 25، 24 و 23 درصد واریانس توجیهی قرار داشت. برای صفت عملکرد راتون بزرگ‌ اثرترین QTL شناسایی شده روی کروموزم 6 به­نام qyr6 باتوجیه 20 درصد از واریانس فنوتیپی این صفت قرار داشت.‌ برای صفت وزن صد دانه QTL شناسایی شده روی کروموزوم‌ 8 برای صفت عملکرد دانه راتون برای اولین بار در این تحقیق شناسایی شد.
متن کامل [PDF 652 kb]   (1924 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: اصلاح نباتات، بیومتری
دریافت: 1396/12/19 | ویرایش نهایی: 1398/1/25 | پذیرش: 1396/12/19 | انتشار: 1396/12/19

فهرست منابع
1. Akhgari, H. 1996. Determination of ratoon yield potential in rice (Oryza sativa L.) cultivars. M.Sc Thesis, Islamic Azad University, Karaj Branch, Iran (In Persian).
2. Allahgholipour, M., A.J. Ali, F. Alinia, T. Nagamine and Y. Kojima. 2006. Relationship between rice grain amylose and pasting properties for breeding better quality rice varieties. Plant Breeding, 125: 357-362. [DOI:10.1111/j.1439-0523.2006.01252.x]
3. Anonymouse. 2015. Agricultural statistics, the first volume agricultural crops 2013-2014. Ministry of Agriculture, Department of Planning and Economy, Office of Statistics and Information Technology, (In Persian).
4. Cai, H.W. and H. Morishima. 2002. QTL clusters reflect character associations in wild and cultivated rice. Theoretical and Applied Genetics, 104: 1217-1228. [DOI:10.1007/s00122-001-0819-7]
5. Ebadi, A. A., E. Farshadfar and B. Rabiei. 2013. Mapping QTLs controlling cooking and eating quality indicators of Iranian rice using RILs across three years. Australian Journal of Crop Science, 10: 1494-1502.
6. Hashemi Dezfoli, A., A. Kochaki and M. Benayan Avval. 1995. Increasing crop yield. Mashhad Jahad Daneshgahi Press. First edition, 287 pp (In Persian).
7. Ishimaru, K., M. Yano, N. Aoki, K. Ono, T. Hirose, S. Y. Lin, L. Monna, T. Sasaki and R. Ohsugi. 2001. toward the mapping of physiological and agronomic characters on a rice function map: QTL analysis and comparison between QTLs and expressed sequence tags. Theoretical and Applied Genetics, 102: 793-800. [DOI:10.1007/s001220000467]
8. Jahani M., G. Nematzadeh and G. Mohammadi Nejad. 2016. Evaluation of Agronomic Traits Associated with Grain Yield in Rice (Oryza sativa) Using Regression and Path Analysis. Journal of Crop Breeding. 7: 115-122 (in Persian).
9. Ji, S., X. Luo and S.N. Ahn. 2014. Mapping QTL for ratooning ability in advanced backcross lines from an Oryza sativa x O. rufipogon cross. CNU Journal of Agricultural Science, 41: 1-7. [DOI:10.7744/cnujas.2014.41.1.001]
10. Karbalaei, M., N. Sharafi, R. Erfani and Gh. Nematzadeh. 1997. The potential for increased rice production as a function ratoon and studies. The publication Rice Research Institute. First edition. 55 pp (In Persian).
11. Li, H., J.M. Ribaut, Z. Li and J. Wang. 2008. Inclusive composite interval mapping (ICIM) for digenic epistasis of quantitative traits in biparental populations. Theoretical and Applied Genetics, 116: 243-260. [DOI:10.1007/s00122-007-0663-5]
12. Lincoln, S. E., M.J. Daly and E.S. Lander. 1990. Constructing genetic linkage maps with MAPMAKER: a tutorial and reference manual. Technical Report. Cambridge, MA: Whitehead Institute for Biomedical Research.
13. Lu, B.R. and A. A. Snow. 2005. Gene flow from genetically modified rice and its environmental consequences. Biology Science, 55: 669-678. [DOI:10.1641/0006-3568(2005)055[0669:GFFGMR]2.0.CO;2]
14. McCouch, S.R., L.‎ Teytelman, Y.B. Xu, K.B. Lobos, K. Clare, M. Walton, B. Fu, R. Maghirang, Z.K.‎ Li, Y.Z.‎ Xing, Q.F.‎ Zhang, ‎I.‎ Kono, ‎ M.‎ Yano, ‎R. Fjellstrom, G. DeClerck, D.‎ Schneider, S.‎ Cartinhour, D. ‎Ware and L. ‎Stein. 2002. Development and mapping of 2240 new SSR markers for rice (Oryza sativa L.) DNA Research. 9: 199-207. [DOI:10.1093/dnares/9.6.199]
15. Murray, M.G. and W.F. Thompson. 1980. Rapid isolation of high molecular weight plant. DNA Nucleic Acids Research, 8: 4321-4325. [DOI:10.1093/nar/8.19.4321]
16. Rahemi M. R., Kazemitabar S.K., A. Moumeni and A.A. Ebadi, 2009. Evaluation of Genetic Diversity by Using of Link Maker for Amylase Content of Some Iranian Local Rice Cultivars. Journal of Crop Breeding, 1:1-10 (in Persian).
17. Tan, Z.B., L.S. Shen, Z.L. Yuan, C.F. Lu, Y. Chen, K.D. Zhou and L.H. Zhu.1997. Identification of QTLs for ratooning ability and grain yield traits of rice and analysis of their genetic effects. Acta Agronomica Sinica, 23: 289-295.
18. Temnykh, S., W.D. Park, N. Ayres, S. Cartinhour, N. Hauck, L. Lipovich, Y.G. Cho, T. Ishii, and S.R. McCouch. 2000. Mapping and genome organization of microsatellite sequences in rice (Oryza sativa L.) Theoretical and Applied Genetics, 100: 697-712. [DOI:10.1007/s001220051342]
19. Wang, J.K. 2009. Inclusive composite interval mapping of quantitative trait genes. Acta Agronomica Sinica, 35: 239-245. [DOI:10.3724/SP.J.1006.2009.00239]
20. Yang, C.H., Y.P. Wang T.U. Bin, L.I. Ting, H.U. Liang and L.I. Shi-Gu. 2012. QTL analysis of rice Ratooning ability and related agronomic traits by using RILs Populations. Acta Agronomica Sinica, 7: 1240-1246. [DOI:10.3724/SP.J.1006.2012.01240]
21. Zhenbo, T., S. Lishuang, Y. Zuolian, L. Chaofu, C.Ying, Z. Kaida and Z. Lihuang. 1997. Identification of QTLs for rationing ability and grain yield traits of rice and analysis of their genetic effects. Acta Agronomica Sinica, 23: 289-295.

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA

بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.

کلیه حقوق این وب سایت متعلق به پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

© 2024 CC BY-NC 4.0 | Journal of Crop Breeding

Designed & Developed by : Yektaweb