دوره 9، شماره 22 - ( تابستان 1396 )
جلد 9 شماره 22 صفحات 22-14 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Honari F, Vessal S, Babaean Jelodar N A, Bagheri N A. (2017). Assessment of Genetic Diversity for some Candidate Edible Seed Watermelon Genotypes using SSR Markers and Morphological Traits. J Crop Breed. 9(22), 14-22. doi:10.29252/jcb.9.22.14
URL: http://jcb.sanru.ac.ir/article-1-836-fa.html
URL: http://jcb.sanru.ac.ir/article-1-836-fa.html
هنری فرشته، وصال سعید رضا، بابائیان جلودار نادعلی، باقری نادعلی. ارزیابی تنوع ژنتیکی ژنوتیپ‌های منتخب هندوانه بذر آجیلی با استفاده از نشانگر
مولکولی ریزماهواره و صفات مورفولوژیکی پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی 1396; 9 (22) :22-14 10.29252/jcb.9.22.14
1- دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
2- دانشگاه فردوسی مشهد
2- دانشگاه فردوسی مشهد
چکیده: (5471 مشاهده)
هندوانه بذر آجیلی یکی از محصولات مهم درآمدزا در مناطق دیم کاری استانهای سه گانه خراسان به شمار میرود که تاکنون مطالعات چندانی در مورد آن انجام نشده است. در این پژوهش تنوع ژنتیکی بین پنج ژنوتیپ منتخب هندوانه بذر آجیلی به همراه یک رقم هندوانه تجاری (کریمستون سوییت) از طریق مطالعه صفات مورفولوژیکی و نیز با استفاده از 10 آغازگر ریز ماهواره (SSR) مورد ارزیابی قرار گرفت. 14 صفت مورفولوژیکی طی 45 روز از دوره رشدی گیاه مورد ارزیابی و آنالیزهای آماری قرار گرفت. تجزیه به مؤلفههای اصلی براساس دادههای مورفولوژیکی، ژنوتیپ‌ها را در سه گروه مجزا تفکیک کرد. ژنوتیپ‌های C1 و C14 در یک گروه، C8 و SW در گروه بعدی و C2 و C5 در گروه سوم قرار گرفتند. با تکثیر DNA ژنومی بوسیله آغازگرها و الکتروفورز محصولات حاصل، در مجموع 76 آلل تولید شد که از میان آنها، 42 آلل چند شکل بودند. میانگین تعداد آللهای چند شکل به ازای هر مکان ژنی 6 بود که در دامنه 8-2 قرار داشت. محتوای اطلاعات چند شکل (PIC) نیز بین 46/0 تا 85/0 متغیر بود. آنالیز خوشه‌ای براساس الگوریتم روش جفت گروه بدون وزن با میانگین حسابی (UPGMA) و ضریب تشابه جاکارد برای دادههای مولکولی، ژنوتیپ‌ها را در سه خوشه اصلی قرار داد. دو ژنوتیپ C2 و C5 هرکدام در یک خوشه مجزا قرار گرفتند که گویای حداکثر تفاوت ژنتیکی آنها با سایر ژنوتیپ‌ها است. در این دندروگرام ژنوتیپ‌های C8 و C14 از لحاظ ژنتیکی نزدیکی بالایی به هم داشتند. نمودار پراکنش ژنوتیپ‌ها براساس دو معیار تشابه جاکارد و ضریب همبستگی کوفنتیک نیز وجود تفاوت ژنتیکی قابل توجه بین ژنوتیپ‌های C2 و C5 را با سایر ژنوتیپ‌ها تأیید کرد. در مجموع داده های حاصل از این آزمایش بیانگر وجود تنوع قابل ملاحظه میان این ژنوتیپ‌ها از هر دو جنبه مورفولوژیکی و مولکولی بود که برای اهداف گزینش و به نژادی این محصول میتواند بسیار مهم باشد.
واژه‌های کلیدی: هندوانه بذرآجیلی، تنوع ژنتیکی، صفات مورفولوژیکی، ریزماهواره، تشابه جاکارد، ضریب همبستگی کوفنتیک
فهرست منابع
1. Abedinpour, H. 2013. The study of genetic diversity and relationships among a number of local citrus genotypes using phenotypic traits and molecular. M.Sc. Thesis of Agricultural Biotechnology, Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University, Sari, Iran. 75 pp (In Persian).
2. Anonymous. 2014. News-Analysis of Industry Nuts. http://nutsnews.ir. (In Persian).
3. Botstein, D., R.L. White, M. Skolnick and R.W. Davis. 1980. Construction of genetic linkage map in man using RFLP. American Journal of Human Genetics, 32: 314-331.
4. Elebekkay, M., L. Laarayedh, R. Lamari, H. Hamidi and A. Ferchichi. 2009. Characterization of several local cultivars of Watermelon collected from arid region in Tunisia. Journal of Arid Land Studies, 19: 205-208.
5. Erhihie, E.O. and N.E. Ekene. 2013. Medicinal values on Citrullus lanatus (watermelon): Pharmacological review. International Journal of Research in Pharmaceutical and Biomedical Sciences, 4: 1305-1312.
6. FAO. 2011. FAOSTAT. http://faostat.fao.org/site/339/default.aspx.
7. Gougerdchi, V., S. Dezhsetan, M. Izadi Dogonchi, M.A. Ebrahimi, A. Asghari and B. Sadeghzadeh. 2017. Assessment of Genetic Diversity and Association Analysis for Phonological Traits Related to Drought Escape in Barley Lines using Microsatellite Markers. Journal of Crop Breeding, 8: 69-60 (In Persian).
8. Huh, Y.C., I. Solmaz and N. Sari. 2008. Morphological characterization of Korean and Turkish Watermelon germplasm. Preceding of IX the EUCARPIA meeting on genetics and breeding of Cucurbitaceae, (France), May 21-24.
9. Joobeur, T., G. Gusmini, X. Zhang, A. Levi, Y. Xu, T.C. Wehner, M. Oliver and R.A. Dean. 2006. Construction of a watermelon BAC library and identification of SSRs anchored to melon or Arabidopsis genomes. Theoretical Applied Genetics, 112: 1553-1562. [DOI:10.1007/s00122-006-0258-6]
10. Katzir, N., Y. Tzuri, G. Karchi, Z. Lavi and U. Cregan. 1996. Length polymorphism and homologies of microsatellites in several Cucurbitaceae species. Theoretical and Applied Genetics, 93: 1282-1290. [DOI:10.1007/s001220050367]
11. Kiani, M and GH, Jahanbin. 2006. Assessment of genetic diversity in native population's watermelon in Iran. Iranian Journal of Agricultural Research, 4: 1-16 (In Persian).
12. Khoramipor S., M. Dehdari and R. Amiri Fahliani. 2017. Study of Genetic Diversity in Sorghum (Sorghum Bicolar L.) Genotypes using Microsatellite Markers Journal of Crop Breeding, 8: 123-116 (In Persian).
13. Kwon, Y., Y. Oh, S. Yi, H. Kim, J. An, S. Yang, S. Ok and J. Shin. 2010. Informative SSR markers for commercial variety discrimination in watermelon (Citrulus lanatus). Genes & Genomics, 32: 115-122. [DOI:10.1007/s13258-008-0674-x]
14. Levi, A., C. Thomas, A.P. Keinath and T.C. Wehner. 2001. Genetic diversity among watermelon (Citrullus lanatus and Citrullus colocynthis) accessions. Genetic Resource and Crop Evolution, 48: 559-566. [DOI:10.1023/A:1013888418442]
15. Levi, A., C.E. Thomas, T. Trebish, A. Salmon, J. Karalius, M. Newman, O.U.K. Reddy, Y. Xu and X. Zhang. 2006. An extended linkage map for watermelon based on SRAP, AFLP, ISSR and RAPD markers. Journal of the American Society for Horticultural Science, 131: 393-402. [DOI:10.21273/JASHS.131.3.393]
16. Liliya, K. 2000. Organization of plant genetic resources in Bulgaria Acta Horticulturae, 510: 247-250. [DOI:10.17660/ActaHortic.2000.510.40]
17. Mirkazemi, F. 2012. Technical Publication of Watermelon, 1:1-12 (In Persian).
18. Moaiedi nejad, A., A. Ershadi, J. Abas kohpaigani and F. Dashti. 2010. Genetic diversity among iranian cantaloupe landraces (cucumis melo L.) using microsatellite markers. Agricultural Biotechnology, 9: 42-52 (In Persian).
19. Mohammadi, M. 2003. Molecular analysis of data from the perspective of genetic variation. 9th Iranian Crop Sciences Congress. Iran- Tehran (In Persian).
20. Mujaju, C., J. Sehic, G. Werlemark, L.Garkava-Gustavsson and M. Fatih. 2010. Genetic diversity in vatermelon (Citrullus lanatus) landraces from Zimbabwe revealed by RAPD and SSR markers. Herediats, 147: 142-153. [DOI:10.1111/j.1601-5223.2010.02165.x]
21. Nabipour, A. and A. Nasr Ala Nejad Ghomi. 2014. Guide research in the life sciences (First Edition). Gorgan University of Agricultural Sciences and Natural Resources, 186 pp (In Persian).
22. Naroei, M., M. Allah do, A. GHasemi and H. Fanaei. 2009. Investigation of Genetic Diversity and Broad Sense Heritability in Watermelon Accessions of Sistan. Iranian Horticultural Science, 40: 95-103 (In Persian).
23. Nei, M. and W.H. Li. 1979. Mathematical model for studying genetic variation in terms of restriction endonucleases Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 76: 5269-5273. [DOI:10.1073/pnas.76.10.5269]
24. Semagn, K., A. Bjørnstad and M.N. Ndjiondjop. 2006. An overview of molecular marker methods for plants. African Journal of Biotechnology, 5: 2540-2568.
25. Shi, W., C.F. Yang, J.M. Chen and Y.H. Gou. 2008. Genetic variation among wild and cultivated populations of the Chinese medicial plant Coptis Chinesis (Ranunculaceae). Plant Biology, 10: 485-491. [DOI:10.1111/j.1438-8677.2008.00035.x]
26. Uzan, A. and T. Yesiloglu. 2012. Genetic divercity in Citrus. In: Genetic Diversity in Plants, Caliskan,M. (Ed.), In Tech, pp: 213-231. [DOI:10.5772/32885]
27. Zhang, H., H. Wang and Sh. Guo. 2012. Indentifation and validation of a core set of microsatellite markers for genetic diversity analysis in watermelon, Citrullus lanatus Thunb. Matsum. & Nakai. Euphytica, 186: 329-342. [DOI:10.1007/s10681-011-0574-z]
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
