دوره ۱۰، شماره ۲۶ - ( تابستان ۱۳۹۷ )                   جلد ۱۰ شماره ۲۶ صفحات ۱۶۵-۱۵۳ | برگشت به فهرست نسخه ها


XML English Abstract Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Yaghotipoor A, Farshadfar E, Saeidi M. (2018). Association Analysis for Stability Parameters in Bread Wheat Using ISSR Markers. J Crop Breed. 10(26), 153-165. doi:10.29252/jcb.10.26.153
URL: http://jcb.sanru.ac.ir/article-1-576-fa.html
یاقوتی پور آنیتا، فرشادفر عزت اله، سعیدی محسن. تجزیه ارتباطی برخی از پارامترهای پایداری در گندم نان با استفاده از نشانگرهای ISSR پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی ۱۳۹۷; ۱۰ (۲۶) :۱۶۵-۱۵۳ ۱۰,۲۹۲۵۲/jcb.۱۰.۲۶.۱۵۳

URL: http://jcb.sanru.ac.ir/article-۱-۵۷۶-fa.html


۱- دانشگاه رازی
چکیده:   (۴۵۸۰ مشاهده)

به ­منظور شناسایی نشانگرهای مرتبط با شاخص­های تحمل به خشکی در گندم نان (Triticum aestivum)، از نشانگرهای ISSR استفاده شد. 18 نشانگر مورد استفاده، 92 مکان در 20 ژنوتیپ گندم نان تولید کرد. میزان اطلاعات چند شکل (PIC) از 46/0 (UBC-857، UPC-864، UBC-867 و is9) تا 21/0 (is7) متغیر بود. درصد چندشکلی کل 75/95 درصد برآورد گردید و از بین نشانگرهای مورد استفاده نشانگر UBC-867 با 100 درصد چند شکلی، تعداد بالای
شاخص ­های محتوای چند شکلی، شاخص نشانگر، شاخص نسبت چندشکلی موثر و شاخص قدرت تفکیک و با توجه به تکثیر بالای نوارها و تولید بیشترین نوارهای چند شکل به­ عنوان مناسب
­ترین نشانگر برای گندم در مطالعات بعدی معرفی شد. برای شناسایی نشانگرهای مثبت مرتبط با  پارامتری پایداری، تجزیه رگرسیون گام به گام بین داده ­های ملکولی به­ عنوان متغیرهای مستقل و صفات مطالعه شده به­ عنوان متغیرهای وابسته انجام شد. اکثر آغازگرهای مورد استفاده با صفات مطالعه شده مرتبط بودند. ضریب رگرسیون فینلی و ویلکینسون، ضریب رگرسیون پرکینز و جینکز، آماره حسابی عملکرد، شاخص برتری لین و بینز و شاخص ایمنی اول توسط آغازگرهای بیشتری تبیین شدند. آغازگرهای UBC-848، UBC-869 و is5 بیشترین ارتباط را با پارامترهای پایداری بررسی شده نشان دادند. نتایج نشان داد که نشانگرهای شناسایی شده مرتبط در این مطالعه می­ توانند
به ­خوبی برای ارزیابی  پایداری ژنوتیپ ­های گندم نان  مورد استفاده قرارگیرند و در انتخاب والدین مناسب برای تولید جمعیت جهت نقشه­­ یابی به کار روند. همچنین این نشانگرها برای انتخاب ژنوتیپ ­های برتر به خصوص وقتی که اطلاعاتی از پایه ژنتیکی آن‏ها مانند نقشه پیوستگی در دسترس نیست، مفید می­ باشند. برخی از این نشانگرها با بیش از یک صفت مرتبط بودند که می­ تواند ناشی از اثرات پلیوتروپیک QTL­های مرتبط با هم در صفات مختلف باشد.
 ISSR

متن کامل [PDF 1210 kb]   (۱۳۲۲ دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: اصلاح نباتات
دریافت: 1395/4/15 | پذیرش: 1396/4/10

فهرست منابع
1. Ahangari, A., M. Rasoli and M. Naderi. 2009. Evaluation of effective traits in drought stress resistance in wheat. Agricultural Proceedings Agricultural and Plant Breeding, Markazi Province Agricultural Jihad Organization (In Persian).
2. Abdollahi Mandolkani, B. and H. Azizi. 2014. Association analysis of morphologic traits with by inter-simple sequence repeat markers in Alfalfa (Medicago sativa L.). Journal of Cellular and Molecular Research, 27(2): 260-268 (In Persian).
3. Azizi, H., A., Bernosi, B. Abdollahi Mandolkani and R. Darvish zadeh. 2011. Study of genetic diversity and structure of Alfalfa(Medicago sativa L.) populations using the inter-simple sequence repeat markers. New Genealogy Journal, 6(4): 61-69 (In Persian).
4. Ashraf, M. and P.J. Harris 2005. Abiotic stresses: plant resistance through breeding and molecular approaches. Food Products Press. USA. Binghamton, 725 pp.
5. Briggle, L. and B. Curtis. 1987. Wheat worldwide. Wheat and wheat improvement. 1-32.
6. Gebhardt, C., A. Ballvora, B. Walkemeier, P. Oberhagemann and K. Schüler. 2004. Assessing genetic potential in germplasm collections of crop plants by marker-trait association: a case study for potatoes with quantitative variation of resistance to late blight and maturity type. Molecular Breeding, 13: 93-102. [DOI:10.1023/B:MOLB.0000012878.89855.df]
7. Carvalho, A., M. Matos, J. Lima-Brito, H. Guedes-Pinto and C. Benito. 2005. DNA fingerprint of F1 interspecific hybrids from the Triticeae tribe using ISSRs. Euphytica, 143: 93-99. [DOI:10.1007/s10681-005-2839-x]
8. Culp, T., D. Harrell and T. Kerr. 1979. Some genetic implications in the transfer of high fiber strength genes to upland cotton. Crop Science, 19: 481-484. [DOI:10.2135/cropsci1979.0011183X001900040013x]
9. Ebrahimi, A., M. Naghavi, M. Sabokdast and S.S.A. Moradi. 2011. Association analysis of agronomic traits with microsatellite markers in Iranian barley landraces barley. Modern Genetics Journal, 6(1): 35-43.
10. Gomez, K.A. and A.A. Gomez. 1984. Statistical procedures for agricultural research. John Wiley and Sons. Science, 680 pp.
11. Huang, J. and M. Sun. 2000. Genetic diversity and relationships of sweetpotato and its wild relatives in Ipomoea series Batatas (Convolvulaceae) as revealed by inter-simple sequence repeat (ISSR) and restriction analysis of chloroplast DNA. Theoretical and Applied Genetics, 100: 1050-1060. [DOI:10.1007/s001220051386]
12. Inostroza, L., A. del Pozo, I. Matus, D. Castillo, P. Hayes, S. Machado and A. Corey. 2009. Association mapping of plant height, yield and yield stability in recombinant chromosome substitution lines (RCSLs) using Hordeum vulgare subsp. spontaneum as a source of donor alleles in a Hordeum vulgare subsp. vulgare background. Molecular Breeding, 23: 365-376. [DOI:10.1007/s11032-008-9239-6]
13. Jabbarzadeh, Z., M. Khosh-Khui, H. Salehi and A. Saberivand .2013. Inter simple sequence repeat (ISSR) markers as reproducible and specific tools for genetic diversity analysis of rose species. African Journal of Biotechnology, 9: 6091-6095.
14. Kar, P.K., P.P. Srivastava, A.K. Awasthi and S.R. Urs. 2008. Genetic variability and association of ISSR markers with some biochemical traits in mulberry (Morus spp.) genetic resources available in India. Tree Genetics and Genomes. 4: 75-83 [DOI:10.1007/s11295-007-0089-x]
15. Khaled, A.G.A., M.H. Motawea and A.A. Said. 2015. Identification of ISSR and RAPD markers linked to yield traits in bread wheatunder normal and drought conditions. Journal of Genetic Engineering and Biotechnology. [DOI:10.1016/j.jgeb.2015.05.001]
16. Kraakman A.T., R.E. Niks P.M. Van den Berg P. Stam and F.A. Van Eeuwijk. 2004. Linkage disequilibrium mapping of yield and yield stability in modern spring barley cultivars. Genetics, 168: 435-446. [DOI:10.1534/genetics.104.026831]
17. Li, Q., Q.C. Liu, H. Zhai, D.F. MA, X. Wang, X.Q. Li and Y.P. Wang. 2008. Genetic diversity in main parents of sweetpotato in China as revealed by ISSR markers. Acta Agronomica Sinica, 34: 972-977. [DOI:10.1016/S1875-2780(08)60036-X]
18. Meredith, W.R. and R. Bridge. 1971. Breakup of linkage blocks in cotton, Gossypium hirsutum L. Crop Science, 11: 695-698. [DOI:10.2135/cropsci1971.0011183X001100050027x]
19. Miletic, R., M. Zikic, N. Mitic and R. Nicolic. 2005. Pomological characteristic of superior selections of European filbert (C. avellana L.). Genetica. 37: 103-111. [DOI:10.2298/GENSR0502103M]
20. Motawea, M., A. Said and A. Khaled. 2015. ISSR Markers-Trait Associations and Stability. Plant Breeding Biotechnology, 3(2): 167-177. [DOI:10.9787/PBB.2015.3.2.167]
21. Mohammadi M., R. Karimizadeh, N. Sabaghnia and M.K. Shefazadeh. 2012a. Genotype -Environment Interaction and Yield Stability Analysis of New Improved Bread Wheat Genotypes. Turkish Journal of Field Crops, 17: 67-73.
22. Najaphy, A., R.A. Parchin and E. Farshadfar. 2012. Comparison of phenotypic and molecular characterizations of some important wheat cultivars and advanced breeding lines. Australian Journal of Crop Science, 6: 326.
23. Pritchard, J.K., M. Stephens and P. Donnelly. 2000. Inference of population structure using multilocus genotype data. Genetics, 155: 945-959.
24. Razeghi yadak, F., SH. Haidari and K. Sori. 2010. Effect of drought stress on activity of acid and alkaline phosphatase in seed embryonic axis of two bread wheat cultivars in early stages of germination. Journal of Iranian Crop Science, 41(2): 385-393 (In Persian).
25. Rakshit S., K. Ganapathy, S. Gomashe, A. Rathore, R. Ghorade, M.N. Kumar, K. Ganesmurthy, S. Jain, M. Kamtar and J. Sachan. 2012. GGE biplot analysis to evaluate genotype, environment and their interactions in sorghum multi-location data. Euphytica, 185: 465-479. [DOI:10.1007/s10681-012-0648-6]
26. Rosegrant, M. and M. Agcaoili. 2010. Global food demand, supply, and price prospects to 2010. International Food Policy Research Institute, Washington, DC USA.
27. Semagn, K., Å. Bjørnstad and M. Ndjiondjop. 2006. An overview of molecular marker methods for plants. African Journal of Biotechnology, 5(25): 2540-2568.
28. Virk, P., B. Ford-Lloyd, M. Jackson, H. Pooni, T. Clemeno and H. Newburry. 1996. Marker-assisted prediction of agronomic traits using diverse rice germplasm. 1995. Third International Rice Genetics Symposium, Manila (Philippines). International Rice Research Institute.
29. Vaillancourt, A., K. Nkongolo, P. Michael and M. Mehes. 2008. Identification, characterisation, and chromosome locations of rye and wheat specific ISSR and SCAR markers useful for breeding purposes. Euphytica, 159(3): 297-306. [DOI:10.1007/s10681-007-9492-5]
30. Wang, L.X., H.B. Li, T.C. Gu, L.H. Liu, B.S. Pang, J. Qiu and C.P. Zhao. 2014. Assessment of wheat variety stability using SSR markers. Euphytica, 195(3): 435-452. [DOI:10.1007/s10681-013-1006-z]
31. Wolff, K. and M. Morgan-Richards. 1998. PCR markers distinguish Plantago major subspecies. Theoretical and Applied Genetics, 96(2): 282-286. [DOI:10.1007/s001220050737]
32. Zietkiewicz, E., A. Rafalski and D. Labuda. 1994. Genome fingerprinting by simple sequence repeat (SSR)-anchored polymerase chain reaction amplification. Genomics, 20(2): 176-183. [DOI:10.1006/geno.1994.1151]

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA

ارسال پیام به نویسنده مسئول


بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.

کلیه حقوق این وب سایت متعلق به پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی می باشد.

طراحی و برنامه نویسی: یکتاوب افزار شرق

© 2025 CC BY-NC 4.0 | Journal of Crop Breeding

Designed & Developed by: Yektaweb