XML English Abstract Print


گروه علوم و زیست فناوری گیاهی، دانشکده علوم و فناوری زیستی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایران
چکیده:   (129 مشاهده)
چکیده مبسوط
مقدمه و هدف: پروتئین­های NFXL1 و NFXL2 دارای موتیف­ های انگشت روی شامل (موتیف اتصال DNA و انگشت (PHD هستند که به­ طور بالقوه برهم کنش پروتئین را واسطه­ گری می­ کنند. ژن­ های NF-X نقش مهمی در پاسخ به سیگنالینگ دفاعی با استفاده از هورمون­های گیاهی دارد.
مواد و روش ­ها: در این مطالعه، 12 ژن NF-X در جو، ذرت و گندم انتخاب شدند. ساختار ژن، الگوهای دوبرابرشدگی و درخت فیلوژنتیک برای 12 فاکتور رونویسی NF-X در سه گونه مورد آنالیز قرار گرفت. همچنین، تجزیه و تحلیل مقایسه ای برای شناسایی ارتولوگ­ها و پارالوگ های NF-X در ژنوم ذرت، جو و گندم انجام شد.
یافته­ ها: درخت فیلوژنتیک NF-X از جو و ذرت و گندم به  دو گروه تقسیم ­بندی شدند. آنالیز ساختاز ژنی نشان داد که تعداد اگزون ژن­های NF-X بین 1 تا 13متغیر است. آنالیز سینتنی ژن­های NF-X جو، ذرت و گندم نشان داد که شباهت TaNFXL1.2 با  HvNFXL1و HvNFXL2  باTaNFXL1.3 ، TaNFXL2،TaNFXL2.1  و ZmNFXL1  با ZmNFXL1.1   بیش از 90٪ می­ باشد. آنالیز ژن­های NF-X  نشان داد که دوبرابرشدگی تاندوم و دوبرابرشدگی سگمنتال نقش مهمی در گسترش ژنوم جو و ذرت و گندم دارد. با این حال، تعداد دوبرابرشدگی تاندوم و سگمنتال، نشان داد که این عوامل از عوامل اصلی در تکامل ژن­های NF-X هستند. این اولین مطالعه برای مقایسه ژن­های NF-X در سه گونه گیاهی است،. پیش­ بینی عناصر تنظیمی نشان داد کهNF-YC ،NF-YB ،NF-YA ، bHLH ، myb / SANT ، WRKY ، Dof  و Trihelix  بالاترین فراوانی را در ناحیه آغازگر ژن­های NF-X داشتند. ژن­های HvNF-X2 و ZmNF-X2 و TaNF-X2 بالاترین تعداد سیس المنت­ها را به خود اختصاص دادند. آنالیز بیان ژن­های NF-X نشان داد که این ژن­ها تقریبا در تمامی مراحل رشدی افزایش بیان نشان دادند.
نتیجه ­گیری: یافته­ های ما می­ تواند به عنوان منبع مفیدی برای مطالعات آینده ژن­های NF-X در مطالعات مقایسه ­ای بین گونه­های مختلف گیاهی در نظر گرفته شود. هدف از این مطالعه، شناسایی و توصیف ژن­های NF-X در سه گونه از طریق روش تجزیه و تحلیل ژنوم بود. ژن­هایHvNFX1 ،  HvNF-X2 و ZmNFXL1.1  بیان ژن را در تمام مراحل رشدی نشان دادند. ساختار ژن در اکثر پروتئین­های هر گروه مشابه بود که با طبقه بندی فیلوژنتیک ژن­های NF-X مطابق بود.


 
     
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: بيوتكنولوژي گياهي
دریافت: 1400/3/31 | ویرایش نهایی: 1401/5/15 | پذیرش: 1400/9/28

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA

ارسال پیام به نویسنده مسئول


بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.

کلیه حقوق این وب سایت متعلق به پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

© 2022 CC BY-NC 4.0 | Journal of Crop Breeding

Designed & Developed by : Yektaweb