در این مطالعه به منظور شناسایی نشانگرهای ملکولی مرتبط با ۲۲ صفت آگرومورفولوژیک در ۴۸ توده مختلف آفتابگردان آجیلی بر اساس مدلهای GLM و MLM، از ۱۲ آغازگر مبتنی بر رتروترنسپوزن (۷ آغازگر IRAP و ۵ آغازگر REMAP) استفاده شد. تجزیه کلاستر با روش Neighbor Joining، تودههای آفتابگردان مورد مطالعه را به ۳ گروه اصلی تقسیمبندی کرد. مطالعه ساختار جمعیت به عنوان پیشنیازی برای انجام تجزیه ارتباط به روش بیزین، نشان داد که ۲ زیر گروه احتمالی (۲K=) در جمعیت مورد مطالعه وجود دارد. در تجزیه ارتباط به روش GLM و MLM، به ترتیب ۱۳۱ و ۱۱۷ مکان مرتبط (۰۱/۰>P) با صفات مورد مطالعه در محیطهای مختلف تحت بررسی شناسایی شدند. وجود نشانگرهای مشترک در میان برخی صفات بررسی شده در مطالعه حاضر ممکن است ناشی از اثرات پلیوتروپی و یا پیوستگی نواحی ژنومی دخیل در کنترل صفات باشد. نتایج بدست آمده از این مطالعه اطلاعات ارزشمندی در زمینه مبنای ژنتیکی صفات مورد مطالعه ارائه داد که از این اطلاعات میتوان در برنامههای اصلاحی و تولید ارقام با میزان عملکرد بالا در آفتابگردان استفاده نمود.