نشانگرهای مولکولی ابزاری برای به‌نژادی، غربالگری و تعیین خصوصیات ژنتیکی ژنوتیپ‌ها می‌باشند. در گیاهان زراعی گزینش به‌کمک نشانگرهای مولکولی برای صفات مرتبط با کیفیت محصول و مقاومت به آفات و بیماری‌ها گسترش یافته است. در این مطالعه غربال 40 نتاج نسل ‌ F₂ ‌ از تلاقی‌های ( M-83-17/3/Dove”S”/Buc”S”//2^*Darab/4/Pishtaz/3/Ww33/Vee”S”//Niknejad ) اقلیم معتدل کشور با نشانگرهای جایگاه‌ نشانمند از توالی ( STS ) با توان تشخیص آلل‌های ^* 2، 18+17 و 10+5 در مکان‌های ژنی Glu-1 که بیشترین اثر را در افزایش کیفیت گلوتن دارا می‌باشند، صورت گرفت و از بین 40 نتاج جامعه F₂ تعداد 12 نتاج واجد هر سه آلل برتر در نسل F₃ در مزرعه تحقیقاتی کشت شدند. از میان 12 نتاج نسل F₃ ، شش نتاج با ده نمونه از هر جمعیت با بهترین خصوصیات ظاهری و صفات مورفولوژیکی انتخاب و با استفاده از نشانگرهای اختصاصی افراد برتر به نسل F₄ انتقال یافتند. نتایج حاصل از نشانگرهای مولکولی در نسل F₂ با نتایج حاصل از آزمون ارتفاع رسوب SDS هماهنگی داشت و آلل‌های ^* 2، 18+17 و 10+5 همبستگی مثبت و معنی‌داری را با ارتفاع رسوب داشتند. تجزیه خوشه‌ای با الگوریتم بین‌گروهی، نتاج را بر اساس آلل‌های پر کیفیت به پنج گروه با ترکیبات متفاوتی از هر یک از سه آلل نامبرده و بر اساس حجم رسوب SDS به سه گروه با حجم رسوب SDS بالا، متوسط و پایین تفکیک نمود.