<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Journal of Crop Breeding</title>
<title_fa>پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی</title_fa>
<short_title>J Crop Breed</short_title>
<subject>Agriculture</subject>
<web_url>http://jcb.sanru.ac.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2228-6128</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2676-4628</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii></journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.61186/jcb</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid></journal_id_sid>
<journal_id_nlai></journal_id_nlai>
<journal_id_science></journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1396</year>
	<month>12</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2018</year>
	<month>3</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>9</volume>
<number>24</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>جداسازی و بررسی بیان ایزوفرم فتوسنتزی ژن فسفوانول پیروات کربوکسیلاز در گیاه شورزیست آلوروپوس لیتورالیس تحت تنش شوری 
</title_fa>
	<title>Isolation and Gene Expression Investigation in Photosynthetic Isoform of Phosphoenolpyruvate Carboxylase Gene in Halophytic Grass Aeluropus Littoralis under Salinity Stress</title>
	<subject_fa>اصلاح نباتات، بیومتری</subject_fa>
	<subject>اصلاح نباتات، بیومتری</subject>
	<content_type_fa>پژوهشي</content_type_fa>
	<content_type>Research</content_type>
	<abstract_fa>&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:2  mitra;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp; با توجه به این که کشاورزی دنیا با دو معضل گرم شدن زمین و شوری خاک روبرو است، بررسی مولکولی گیاهان مقاوم به شوری و گرما کمک زیادی به درک&amp;nbsp; مکانیسم مقاومت و انتقال آن به گیاهان زراعی می&amp;shy;کند.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:2  mitra;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; &lt;strong&gt;آنزیم فسفوانول پیروات کربوکسیلاز (&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;PEPc&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:2  mitra;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;) &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:2  mitra;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;واکنش برگشت ناپذیز فسفو انول پیروات را در حضور یون بی کربنات&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; &lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:2  mitra;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;به منظور تولید اگزالو استات در گونه&amp;shy;هایی کاتالیز می&amp;shy;کند که در آنها کربو کسیلاسیون اولیه&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;CO&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt; &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:2  mitra;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;&amp;nbsp;مزوفیلی در طول فتوسنتز&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; &lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;C4&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:2  mitra;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;و متابولیسم اسید کراسولاسه انجام می&amp;shy;شود. در پژوهش حاضر بخشی از توالی کد شونده &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:2  mitra;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;(&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;CDS&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:2  mitra;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;) &lt;strong&gt;ژن &lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;pepc&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:2  mitra;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; در گیاه شورزیست &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:2  mitra;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;چمن&#8204; شور ساحلی یا برت&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:2  mitra;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; با نام علمی &lt;em&gt;آلوروپوس لیتورالیس&lt;/em&gt; با طول 678 جفت باز جداسازی و با شماره دسترسی &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;KP122945 (EC:4.1.1.31)&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:2  mitra;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; در بانک ژن &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;NCBI &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:2  mitra;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;&amp;nbsp;ثبت شد، سپس الگوی تمایل کدونی و آنالیز کمی بیان آن در غلظت&amp;shy;های شاهد (0)&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; &lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:2  mitra;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;و 600 میلی&amp;shy;مولار نمک کلرید سدیم (&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;Nacl&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:2  mitra;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;) با استفاده از روش &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;Real-time PCR &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:2  mitra;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;&amp;nbsp;مطالعه شد. نتایج نشان دادند که قطعه جداسازی شده بیشترین همولوژی در سطح پروتئین را با گونه&amp;shy;های &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;Eragrostis minor&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:2  mitra;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; &amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:2  mitra;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;و &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;japonica&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt; &lt;strong&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;Zoysia&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:2  mitra;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; دارد. &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:2  mitra;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;همچنین شاخص تمایل کدنی &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;(CAI)&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:2  mitra;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; آن 82/0 برآورد گردید. &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:2  mitra;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;بررسی کمی بیان ژن تحت تنش 600 میلی مولار نمک نشان داد که سطح رونوشت ژن &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;pepc&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:2  mitra;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; در پاسخ به شرایط تنش، حدود 3 برابر (نسبت به شاهد) افزایش یافته است&lt;em&gt;.&lt;/em&gt; بنابراین افزایش بیان ژن فتوسنتزی &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;pepc&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt; &lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:2  mitra;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;به عنوان یکی از مکانیسم&amp;shy;های ایجاد مقاومت به تنش شوری در گیاه&lt;em&gt; آلوروپوس لیتورالیس &lt;/em&gt;پیشنهاد می&amp;shy;شود.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;</abstract_fa>
	<abstract>C4 plants have very high photosynthetic efficiency under drought stress due to lower water usage and do not require the opening and closing of stomata. This advantage has been created by complementary mechanisms of primary carboxylation in leaves mesophilic cells. In species which are initial carboxylation of mesophilic CO2 during C4 photosynthesis and crassulacean acid metabolism done, the PEPc enzyme catalyses the irreversible reaction of phosphoenolpyruvate in the presence of bicarbonate ions to produce oxaloacetate. The aim of the present study was to partial isolation of &lt;em&gt;pepc&lt;/em&gt; coding sequence from halophytic grass &lt;em&gt;Aeluropus littoralis&lt;/em&gt;, studying codon bias pattern and also quantitative analysis of its expression in 0 (control) and 600 mM NaCl relative to beta actin gene expression as internal control using Real-time PCR. As a result, a 678 bp fragment of &lt;em&gt;pepc&lt;/em&gt; gene coding sequence was isolated and registered in NCBI gene bank under KP122945 accession number. The isolated fragment showed highest homology (in protein level) with &lt;em&gt;Eragrostis minor&lt;/em&gt; and &lt;em&gt;Zoysia&lt;/em&gt; &lt;em&gt;japonica&lt;/em&gt; species and its CAI index was estimated 0.82. Finally, the quantitative analysis of gene expression under 600 mM salt stress showed that the level of &lt;em&gt;pepc&lt;/em&gt; gene transcription was increased about 3 times (compared to control)&amp;nbsp; in response to stress.</abstract>
	<keyword_fa>آلوروپوس لیتورالیس, فسفوانول پیروات کربوکسیلاز, تنش شوری, بیان ژن, تمایل کدنی</keyword_fa>
	<keyword>Aeluropus littoralis, Codon bias,  Gene expression, Phosphoenolpyruvate  carboxylase, Salinity stress </keyword>
	<start_page>69</start_page>
	<end_page>78</end_page>
	<web_url>http://jcb.sanru.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1-310&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Elham </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Younesi-Melerdi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>الهام</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>یونسی ملردی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846009532</code>
	<orcid>10031947532846009532</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Sari Agricultural Sciences and  Natural Resources University (SANRU), Sari, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Ghorban Ali </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Nematzadeh</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>قربانعلی</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>نعمت زاده</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846009533</code>
	<orcid>10031947532846009533</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Sari Agricultural Sciences and  Natural Resources University (SANRU), Sari, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Ehsan </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Shokri</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>احسان</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>شکری</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846009534</code>
	<orcid>10031947532846009534</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Sari Agricultural Sciences and  Natural Resources University (SANRU), Sari, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
