fa شناسایی رونوشت‌های با افزایش تظاهر در رقم برنج (Oryza sativa L.) مقاوم به تنش شوری با استفاده از تکنیک cDNA-AFLP اصلاح نباتات، بیومتری اصلاح نباتات، بیومتری پژوهشي Research <strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">تنش شوری یکی از مهم&shy;ترین تنش&shy;های غیرزیستی برای برنج است که به&shy;طور منفی رشد و باروری آن را متأثر می&shy;سازد. در این پژوهش اثرات تنش شوری بر بیان افتراقی برخی از ژن&shy;های مسئول در تنش شوری در دو ژنوتیپ برنج متحمل و حساس به شوری (</span></span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">FL478</span></span></span></strong><strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> و </span></span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">IR29</span></span></span></strong><strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">) با استفاده از تکنیک </span></span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">cDNA-AFLP</span></span></span></strong><strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> مورد بررسی قرار گرفت. از میان </span></span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">TDF</span></span></span></strong><strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">های (</span></span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">Transcript Derived Fragments</span></span></span></strong><strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> یا قطعات حاصل از رونوشت&shy;ها) حاصل از 2 آنزیم برشی و 18 ترکیب آغازگری که در پاسخ به تنش شوری در رقم مقاوم در مقایسه با تیمار شاهد و حساس افزایش بیان نشان داده بودند 28 </span></span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">TDF</span></span></span></strong><strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> جدا شد که در نهایت 21 عدد از آن&shy;ها کلون، توالی&shy;یابی و در بانک ژن ثبت گردیدند و سپس با استفاده از الگوریتم بلاست مورد آنالیز قرار گرفتند. </span></span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">TDF</span></span></span></strong><strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">های شناسایی شده در این مطالعه متعلق به گروه&shy;های متفاوتی از ژن&shy;ها شامل متابولیسم، ترارسانی سیگنال، فاکتورهای رونویسی، سمیت&shy;زدایی، سیستم ترانسپورت و دیگر مکانیسم&shy;های مرتبط با تنش شوری بودند که این امر بیانگر آن است که تعداد زیادی از فرآیندها در پاسخ به تنش شوری درگیر هستند. سپس تعدادی از این ژن&shy;ها برای تأئید الگوهای بیانی به دست آمده توسط </span></span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">cDNA-AFLP</span></span></span></strong><strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> با استفاده از آنالیز </span></span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">Real time PCR</span></span></span></strong><strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> انتخاب گردیدند که نتایج به دست آمده از این آزمایش الگوهای بیانی ردیابی شده با استفاده از تکنیک </span></span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">cDNA-AFLP</span></span></span></strong><strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> را تأئید نمود.</span></span></strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> <strong>نتایج این تحقیق نشان داد که </strong></span></span><strong><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">cDNA-AFLP</span></span></span></strong><strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> تکنیک قدرتمندی برای بررسی الگوی بیان ژن&shy;های برنج تحت تنش شوری می&shy;باشد. علاوه بر این یافته&shy;های ما به روشن نمودن اساس مولکولی اثرات تنش شوری بر ژنوم برنج و شناسایی ژن&shy;هایی که می&shy;توانند تحمل به شوری برنج را افزایش دهند کمک می&shy;نماید.</span></span></strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"></span></span> &nbsp; &nbsp; &nbsp; Salt stress is one of the main abiotic stresses for rice that causes negative effects on its growth and productivity. In present study, effects of salt stress on differential gene expression of some genes which are responsible in salt stress were investigated in two rice tolerant and sensitive genotypes (FL478 and IR29) by applying cDNA-AFLP technique. Among the TDFs (Transcript Derived Fragments<span dir="RTL"> (</span>were generated by 2 restriction enzymes and 18 primer combination that displayed up-regulation expression in tolerant line with respect to the control treatment and sensitive line in response to salt stress, 28 TDF were separated and 21 of them were cloned, sequenced and submitted in gene bank and finally they were analyzed by BLAST algorithm. All known TDFs in current study were belonged to different groups of genes related to metabolism, signal transduction, transcription factors, detoxification, transport system and other mechanism related to salt stress which suggests a lot of process to be involved in salt stress responses. Some genes were further selected for validation of cDNA-AFLP expression patterns using real-time PCR. The results of real-time PCR confirmed the expression patterns that were detected using the cDNA-AFLP technique. The results of this research show that cDNA-AFLP is a powerful technique for investigating the expression pattern of rice genes under salt stress. Moreover our finding will help either elucidation the molecular basis of salt stress effects on rice rice or identification those genes that could increase the salt tolerance of rice plant. تنش شوری, cDNA-AFLP , رونوشت, بیان ژن, برنج CDNA-AFLP, Gene expression, Oryza sativa, Salt stress, Transcript 125 137 http://jcb.sanru.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1-288&slc_lang=fa&sid=1 Fatemeh Zare فاطمه زارع 10031947532846009620 10031947532846009620 Yes Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری Gholam Ali Ranjbar غلامعلی رنجبر 10031947532846009621 10031947532846009621 No Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری Ali Reza Tarang علیرضا ترنگ 10031947532846009622 10031947532846009622 No Agricultural Biotechnology Research and Institute Iran, Gilan branch, Agricultural Research, Training and Promotion Organization, Rasht, Iran سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی Hamid Najafi Zarrini حمید نجفی زرینی 10031947532846009623 10031947532846009623 No Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری