<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Journal of Crop Breeding</title>
<title_fa>پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی</title_fa>
<short_title>J Crop Breed</short_title>
<subject>Agriculture</subject>
<web_url>http://jcb.sanru.ac.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2228-6128</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2676-4628</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii></journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.61186/jcb</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid></journal_id_sid>
<journal_id_nlai></journal_id_nlai>
<journal_id_science></journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1397</year>
	<month>9</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2018</year>
	<month>12</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>10</volume>
<number>28</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>ارزیابی قابلیت نشانگرهای رتروترانسپوزون در بررسی تنوع ژنتیکی برخی جمعیت‌های تربچه
</title_fa>
	<title>Evaluation of the Ability of Retrotransposon Markers to Study the Genetic Diversity in some Populations of Radish (Raphanus Sativus)</title>
	<subject_fa>بيوتكنولوژي گياهي </subject_fa>
	<subject>بيوتكنولوژي گياهي </subject>
	<content_type_fa>پژوهشي</content_type_fa>
	<content_type>Research</content_type>
	<abstract_fa>&lt;div style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:11px;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background:white;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:tahoma,sans-serif;&quot;&gt;تربچه از تیره شب&#8204; بویان، دارای موادی از جمله سنوول، مالوین کلراید، ساپوژنین، سولفورافان و رافانین بوده و از خواص درمانی متعددی برخوردار است. در تحقیق حاضر تنوع ژنتیکی 7 جمعیت تجاری/بومی گـیاه دارویی تربچه با استفاده از نشانگر رتروترانسپوزونی&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;background:white;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:calibri,sans-serif;&quot;&gt;IRAP&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background:white;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:tahoma,sans-serif;&quot;&gt;&amp;nbsp;بررسی شد. آغازگر ترکیبی&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;background:white;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:calibri,sans-serif;&quot;&gt;LTR2 &amp;&amp;nbsp;LTR15&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background:white;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:tahoma,sans-serif;&quot;&gt;&amp;nbsp;با 1 باند کمترین تعداد و آغازگر&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;background:white;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:calibri,sans-serif;&quot;&gt;LTR23&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background:white;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:tahoma,sans-serif;&quot;&gt;&amp;nbsp;با 16 باند بیشترین تعداد را در میان باندهای تولیدی توسط هر آغازگر داشتند. میانگین تعداد باند در کل جایگاه&amp;shy; ها برابر 93/6 بود. بیشترین میزان شاخص چندشکلی (41/0) مربوط به آغازگر&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;background:white;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:calibri,sans-serif;&quot;&gt;Sukkula&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background:white;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:tahoma,sans-serif;&quot;&gt;&amp;nbsp;و کمترین میزان شاخص چندشکلی (18/0) مربوط به آغازگر&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; &lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;background:white;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:calibri,sans-serif;&quot;&gt;LTR2-&amp;nbsp;LTR15&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background:white;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:tahoma,sans-serif;&quot;&gt;&amp;nbsp;و با میانگین کل 28/0 مشاهده گردید. بیشترین میزان شاخص نشانگری (1/4) مربوط به آغازگر&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;background:white;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:calibri,sans-serif;&quot;&gt;LTR3&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background:white;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:tahoma,sans-serif;&quot;&gt;&amp;nbsp;و کمترین میزان شاخص نشانگری (18/0) مربوط به ترکیب آغازگری&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;background:white;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:calibri,sans-serif;&quot;&gt;LTR15 &amp;&amp;nbsp;LTR2&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background:white;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:tahoma,sans-serif;&quot;&gt;&amp;nbsp;مشاهده گردید. بیشترین میزان تعداد باند مؤثره، شاخص تنوع شانن و شاخص تنوع نی به ترتیب 82/1، 64/0 و 45/0 متعلق به آغازگر&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;background:white;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:calibri,sans-serif;&quot;&gt;Sukkula&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background:white;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:tahoma,sans-serif;&quot;&gt;&amp;nbsp;و کمترین میزان تعداد باند مؤثره، شاخص تنوع شانن و شاخص تنوع نی به ترتیب 18/1، 27/0 و 15/0 متعلق به آغازگــر&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;background:white;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:calibri,sans-serif;&quot;&gt;rtdk&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background:white;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:tahoma,sans-serif;&quot;&gt;&amp;nbsp;بود. در بیــن جمعیت &amp;shy;های تربچه بیشترین درصد مکان چندشکل، تعـداد باند مؤثره، شاخـص تنـوع نی و شاخص تنوع شانن به تـرتیـب 85/46، 05/1، 17/0 و 26/0 متعلق به جمعیت&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;background:white;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:calibri,sans-serif;&quot;&gt;Profit&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background:white;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:tahoma,sans-serif;&quot;&gt;&amp;nbsp;بود. تغییرات درون و بین جمعیت&#8204;ها با استفاده از تجزیه واریانس مولکولی نشان داد که 59 درصد کل تغییرات ژنتیکی به تنوع درون جمعیت&#8204;ها اختصاص داشت.&amp;nbsp;نتایج&amp;nbsp;این تحقیق نشان داد که می&amp;shy; توان از جمعیت&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;background:white;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:calibri,sans-serif;&quot;&gt;Profit&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background:white;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:tahoma,sans-serif;&quot;&gt;&amp;nbsp;(چون دارای بیشترین درصد چندشکلی و تنوع شانن و نی و تعداد باند موثره بوده) به&#8204;عنوان یکی از پایه&#8204;های پدری یا مادری و یا دهنده ژن انتخاب در اصلاح تربچه &amp;shy;های ایران استفاده کرد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/div&gt;
</abstract_fa>
	<abstract>&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp; Radish belonging to the &lt;em&gt;Brassicaceae&lt;/em&gt; family, contains some componds such as cineol, malvin Chloride, Sapogenin, Sulforaphane and Raphanin and has many therapeutic properties. In this study, IRAP retrotransposon marker was used for evaluation of genetic diversity in seven commercial and native populations of Radish herb. The least number of bands (1) were produced by LTR2 &amp; LTR15 (primer combinations) and the highest number, (16) were produced by LTR23 primer. The mean number of bands in all sites was 6. 39. the most diversity index (0.41) was found for Sukkula primer and the least diversity index (0.18) was related to LTR2-LTR15 primer and also the mean diversity index was 0.28. The highest marker index (4.1) was related to the LTR3 primer and the least marker index (0.18) was related to the LTR15 and LTR2 primer combination. The most number of effective bands, the Shanoon diversity index and the Nei diversity index were 1.82, 0.64 and 0.45, respectively and all belonged to Sukkula primer. The least number of effective bands, the Shanoon diversity index and the Nei diversity index were 1.18, 0.27 and 0.15, respectively belonged to the rtdk primer. Among radish populations, the most percentage of polymorphic location, effective band, the Shanoon diversity index and the Nei diversity index were 46.85, 1.305, 0.17 and 0.26, respectively. Molecular variance analysis among and between populations showed that 59% of the total genetic diversity was among populations. The results of this study showed that the population of Profit could be used as a parent or maternal parent or gene selection provider in Iran&amp;#39;s radish breeding, since it showed the most polymorphism, the Shanoon diversity index and the Nei diversity index and number of effective bands.</abstract>
	<keyword_fa> تنـوع ژنتیکی, شباهت ژنتیکی, IRAP, Raphanus sativus</keyword_fa>
	<keyword>Genetic Diversity, Genetic similarity, IRAP, Radish</keyword>
	<start_page>27</start_page>
	<end_page>37</end_page>
	<web_url>http://jcb.sanru.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-405-2&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Mostafa</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>tabatabaee</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مصطفی</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>طباطبایی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>seyedtabatabaie@gmail.com</email>
	<code>100319475328460010079</code>
	<orcid>100319475328460010079</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>University of Zabol</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه زابل</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Fateme</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>haddadi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>فاطمه</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>حدادی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>100319475328460010080</code>
	<orcid>100319475328460010080</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>University of Zabol</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه زابل</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Hossein </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Kamalaldini</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>حسین</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>کمال الدینی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>100319475328460010081</code>
	<orcid>100319475328460010081</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>University of Zabol</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه زابل</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Bahman </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>fazelinasab</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>بهمن</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>فاضلی نسب</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>bfazelinasab@gmail.com</email>
	<code>100319475328460010082</code>
	<orcid>100319475328460010082</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>University of Zabol</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه زابل</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
