fa ارزیابی راندمان تعدادی از ژن‌های مرجع در آلوروپوس تحت شرایط تنش شوری اصلاح براي تنش هاي زنده و غيرزنده محيطي Special پژوهشي Research <strong><span style="color:black;"><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">استفاده از گونه‌های وحشی گیاهان زراعی یا خویشاوندان هالوفیت آن&shy;ها در برنامه‌های اصلاحی به&shy;منظور توسعه ارقام زراعی متحمل به شوری و خشکی می‌تواند نتایج مفیدی را به دنبال داشته باشد. اخیرا گیاه آلوروپوس به&shy;عنوان یک مدل هالوفیت برای شناسایی و جداسازی ژن‌های جدید متحمل به شوری مورد توجه محققان قرار گرفته است. در میان روش‌های مورد استفاده برای مطالعات بیان ژن، واکنش زنجیره‌ای پلی‌مراز زمان واقعی یکی از روش‌های مناسب برای ارزیابی میزان بیان </span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">ژ</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">ن است. در این روش کنترل خطا بین نمونه‌ها ضروری به نظر می‌رسد. روشی که به صورت گسترده برای کنترل خطا مورد استفاده قرار می‌گیرد، نرمال کردن سطوح </span></span></span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">RNA</span></span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> با یک ژن مرجع یا خانه‌دار می‌باشد. در این تحقیق </span></span></span></strong><strong><span style="position:relative;top:1.0pt;letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">به&shy;منظور بررسی پایداری بیان ژن‌ها در اندام‌های برگ و ریشه گیاه آلوروپوس، 7 ژن مرجع تحت شرایط تنش شوری مورد بررسی قرار گرفت. نتایج حاصل از تجزیه و تحلیل داده‌ها با استفاده از نرم&shy;افزار </span></span></span></span></strong><strong><span dir="LTR" style="position:relative;top:1.0pt;letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">geNorm</span></span></span></span></strong>&nbsp;<strong><span style="position:relative;top:1.0pt;letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">نشان داد که ژن‌های </span></span></span></span></strong><strong><em><span dir="LTR" style="position:relative;top:1.0pt;letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">ACT11</span></span></span></span></em></strong><strong><span style="position:relative;top:1.0pt;letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">، </span></span></span></span></strong><strong><em><span dir="LTR" style="position:relative;top:1.0pt;letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">Beta actin</span></span></span></span></em></strong><strong><span style="position:relative;top:1.0pt;letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">&nbsp;و </span></span></span></span></strong><strong><em><span dir="LTR" style="position:relative;top:1.0pt;letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">Beta tubulin</span></span></span></span></em></strong><strong><span style="position:relative;top:1.0pt;letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">&nbsp;در برگ و ژن‌های </span></span></span></span></strong><strong><em><span dir="LTR" style="position:relative;top:1.0pt;letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">Beta tubulin</span></span></span></span></em></strong><strong><span style="position:relative;top:1.0pt;letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">&nbsp;و </span></span></span></span></strong><strong><em><span dir="LTR" style="position:relative;top:1.0pt;letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">Beta actin</span></span></span></span></em></strong><strong><span style="position:relative;top:1.0pt;letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">&nbsp;در ریشه دارای بیشترین میزان پایداری هستند. بر اساس آماره توصیفی ژن </span></span></span></span></strong><strong><em><span dir="LTR" style="position:relative;top:1.0pt;letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">ACT11</span></span></span></span></em></strong><strong><span style="position:relative;top:1.0pt;letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">&nbsp;دارای بیشترین همبستگی (836/0 و 722/0 به ترتیب در ریشه و برگ) با شاخص </span></span></span></span></strong><strong><span dir="LTR" style="position:relative;top:1.0pt;letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">BestKeeper</span></span></span></span></strong><strong><span style="position:relative;top:1.0pt;letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">&nbsp;بود. همچنین با توجه به نتایج این برنامه، ژن‌ </span></span></span></span></strong><strong><em><span dir="LTR" style="position:relative;top:1.0pt;letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">Beta tubulin</span></span></span></span></em></strong><strong><span style="position:relative;top:1.0pt;letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">&nbsp;در برگ و ریشه دارای بیشترین پایداری (کمترین ضریب تغییرات) بود. بنابراین می‌توان عنوان کرد که ژن‌های </span></span></span></span></strong><strong><em><span dir="LTR" style="position:relative;top:1.0pt;letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">Beta tubulin</span></span></span></span></em></strong><strong><span style="position:relative;top:1.0pt;letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">، </span></span></span></span></strong><strong><em><span dir="LTR" style="position:relative;top:1.0pt;letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">Beta actin</span></span></span></span></em></strong><strong><span style="position:relative;top:1.0pt;letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">&nbsp;و </span></span></span></span></strong><strong><em><span dir="LTR" style="position:relative;top:1.0pt;letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">ACT11</span></span></span></span></em></strong><strong><span style="position:relative;top:1.0pt;letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">&nbsp;می‌توانند به&shy;عنوان ژن‌های مرجع مناسب در گیاه آلوروپوس به&shy;منظور نرمال‌سازی داده‌های بیانی مورد استفاده قرار بگیرند.</span></span></span></span></strong><br> &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Application of wild type crops or wild relatives&rsquo; cultivars that are halophyte in plant breeding program would provide better results in order to develop cultivars that are resistant toward drought as well as salinity. Recently, <em>Aeluropus littoralis</em> has attracted the attention of researcher in order to identify novel genes and their regulatory elements that are involved in salinity stress. Currently, Quantitative polymerase chain reaction (Q-PCR) is one of the best and sensitive techniques in order to determine the expression profiling of genes in plants. In this method, normalizations of the obtained data with appropriate housekeeping genes are certainly crucial. In the current research, the efficiency of seven reference genes to be employed in the normalization of the data was investigated. Statistical analysis of the data was done via geNorm program and it was demonstrated that the <em>ACT11</em><span dir="RTL">,</span>&nbsp;<em>Beta Actin </em>and<em> Beta tubulin and Beta tubulin </em>and<em> Beta Actin were</em> constitutively expressed in leaf as well as roots, respectively. Based on the gained results through Best Keeper, the <em>ACT11</em> poses the highest correlations with the BestKeeper (0.836 and 0.722 in leaf and root respectively). Additionally, it was shown that the <em>Beta tubulin</em> has the lowest coefficient variation in term of expression in root and leaf. Taken together, it was evidently demonstrated that the <em>ACT11</em><span dir="RTL">,</span>&nbsp;<em>Beta Actin </em>and<em> Beta tubulin </em>are the best reference gene to be employed for the normalization of expression data in the <em>Aeluropus littoralis</em>.<br> &nbsp; آلوروپوس, واکنش زنجیره‌ی پلی‌مراز زمان واقعی, تنش شوری, ژن مرجع, BestKeeperBestKeeperBestkeeper Aeluropus littoralis, Real time PCR, salinity, Reference gene and BestKeeper 110 117 http://jcb.sanru.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-607-1&slc_lang=fa&sid=1 Amin Ebrahimi امین ابراهیمی aminebrahimi@shahroodut.ac.ir 10031947532846007642 10031947532846007642 Yes Shahrood University of Technology دانشگاه صنعتی شاهرود Sajad Rashidi Monfared سجاد رشیدی منفرد rashidims@modares.ac.ir 10031947532846007643 10031947532846007643 No Tarbiat Modares University دانشگاه تربیت مدرس Amir moradi sarabshelli امیر مرادی سرابشلی a.moradi4568@gmail.com 10031947532846007644 10031947532846007644 No Sari Agriculture science and Natural Resource University دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی ساری Parviz heidari پرویز حیدری heidarip@shahroodut.ac.ir 10031947532846007645 10031947532846007645 No Shahrood University of Technology دانشگاه صنعتی شاهرود