fa گروه بندی و بررسی الگوی بیان ژن های خانواده bZIP در ریشه گیاه گوجه فرنگی تحت تنش دمای پایین اصلاح نباتات General پژوهشي Research <p dir="RTL"><strong><span dir="LTR">bZIP&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; </span></strong><strong>&nbsp;یکی از مهم&shy;ترین عوامل رونویسی هستند که در اکثر تنش&shy;ها فعال هستند و باعث بیان و تنظیم تعدادی زیادی ژن در طی تنش&shy;های محیطی می&shy;شوند. گیاه گوجه فرنگی دارای 73 ژن </strong><strong><span dir="LTR">bZIP</span></strong><strong> است که تاکنون این ژن</strong><strong><span dir="LTR">&shy;</span></strong><strong>ها گروه&shy;بندی نشده&shy;اند. در این تحقیق با استفاده از مطالعه نواحی فعالیت و اتصال به </strong><strong><span dir="LTR">DNA</span></strong><strong>، این خانواده بزرگ از عوامل رونویسی گروه&shy;بندی گردید. نتایج </strong><strong>گروه&shy;بندی نشان داد که </strong><strong><span dir="LTR">bZIPs</span></strong><strong> گوجه&shy;فرنگی طبق عملکرد و میزان همولوژی با ژن&shy;های </strong><strong><span dir="LTR">bZIP</span></strong><strong> آرابیدوپسیس در یازده گروه قرار </strong><strong>می&shy;گیرند. سه ژن </strong><strong><span dir="LTR">Solyc06g074320</span></strong><strong>، </strong><strong><span dir="LTR">Solyc01g109880</span></strong><strong> و </strong><strong><span dir="LTR">Solyc10g085210</span></strong><strong> به ترتیب از گروه&shy;های </strong><strong><span dir="LTR">D</span></strong><strong>، </strong><strong><span dir="LTR">I</span></strong><strong> و </strong><strong><span dir="LTR">B</span></strong><strong> برای مطالعه بیان ژن تحت تنش دمای پایین انتخاب شدند. دو ژنوتیپ حساس به سرما (</strong><strong><span dir="LTR">Moneymaker</span></strong><strong>) و مقاوم به سرما (</strong><strong><span dir="LTR">LA1777</span></strong><strong>) گیاه گوجه فرنگی در مرحله گیاهچه&shy;ای تحت شرایط دمای نرمال (23 درجه سانتی&shy;گراد) و دمای پایین (15 درجه سانتی&shy;گراد) برای مطالعه بیان ژن در ریشه کشت گردیدند.&nbsp; نتایج نشان داد که ژن </strong><strong><span dir="LTR">Solyc06g074320</span></strong><strong>&nbsp; کمتر از </strong><strong><span dir="LTR">Solyc01g109880</span></strong><strong> و </strong><strong><span dir="LTR">Solyc10g085210</span></strong><strong> تحت تنش دمای پایین در ریشه گیاه گوجه&shy;فرنگی القاء می&shy;شود. نتایج این بررسی می&shy;تواند نقطه شروعی برای&nbsp; مطالعه عملکردی ژن&shy;های خانواده </strong><strong><span dir="LTR">bZIP</span></strong><strong> در آینده باشد</strong><strong><span dir="LTR">.</span></strong></p> <p>Transcription factors (TFs) are master regulators that control gene clusters Plant bZIP (basic region/leucine zipper) transcription factors play crucial roles in biological processes. The Tomato genome sequence contains 73 genes of bZIP transcription factors.&nbsp; The bZIPs in tomato have never been classified. In this study, 73 genes of bZIP transcription factors were classified in 11 groups by their DNA-binding domains, conserved motifs and phylogeny results. Some bZIP proteins were not classified into any group. The cold-sensitive tomato cultivar (<em>S. lycopersicon</em> cv. Moneymaker) and cold-tolerant of the wild tomato species (<em>S. habrochaites, LA1777) </em>were compared for analyzing gene expression of three slbZIP genes (Solyc06g074320, Solyc01g109880 and Solyc10g085210) in root under sub-optimal temperature (15⁰C) and normal temperature (23⁰C). Our results show that Solyc06g074320gene was induced less than Solyc01g109880 and Solyc10g085210 genes under sub-optimal temperature in tomato root. The results of this work will be for understanding bZIP relationships and important starting point for functional analysis.</p> تنش دمای پایین, عوامل رونویسی, گوجه فرنگی, بیان ژن, کلاس بندی ژن ها Classification, Gene expression, Low temperature, Tomato, Transcription factor 23 17 http://jcb.sanru.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1-152&slc_lang=fa&sid=1 پرویز حیدری 10031947532846003974 10031947532846003974 Yes حمید نجفی زرینی 10031947532846003975 10031947532846003975 No