fa طراحی پرایمرهای اختصاصی برای مطالعه تنوع تک نوکلئوتیدی (SNP) در ژن ها و تعیین عملکرد آنها اصلاح نباتات General پژوهشي Research <p><strong>اطلاعات زیادی در مورد توالی بسیاری از ژن&shy;ها بدون آنکه عملکرد این توالی&shy;ها شناخته شده باشد، وجود دارد. از این رو تحقیقات فراوانی از طریق روش&shy;های ژنتیکی معکوس برای پر کردن شکاف بین ساختار و عملکرد این توالی&shy;ها انجام گرفته است. بدین منظور </strong><strong>آزمایشی با هدف چگونگی طراحی پرایمرهای اختصاصی ژن</strong><strong>،</strong><strong> که بتوانند تنوع تک نوکلئوتیدی و تاثیر آن بر عملکرد ژن را تعیین نمایند، در مرکز بین المللی تحقیقات کشاورزی در مناطق خشک </strong><strong><span dir="LTR">(ICARDA)</span></strong><strong> انجام</strong><strong> گرفته است. ژن&shy;های مورد بررسی در این آزمایش دو ژن متحمل به تنش شوری در جو، </strong><strong><span dir="LTR">CBL4</span></strong><strong> و </strong><strong><span dir="LTR">HvHKT1</span></strong><strong>،</strong><strong> بوده است و هشت جفت </strong><strong>پرایمر برای این دو ژن طراحی گردید. کارآیی پرایمرها برای تکثیر منطقه مورد نظر و نشان دادن تنوع تک نوکلئوتیدی از طریق واکنش زنجیره&shy;ای پلیمراز1 و توالی یابی قطعات تکثیری مورد ارزیابی قرار گرفت. همه پرایمرهای طراحی شده دارای قابلیت بالایی از نظر تکثیر قطعات ژنومی مربوط و تعیین تنوع تک نوکلئوتیدی بودند. این پرایمرها اختصاصی بوده و از مناطق کدکننده ژن طراحی شدند. لذا به کمک آنها می&shy;توان نقش تنوع نوکلئوتیدی موجود بین ژنوتیپ&shy;های مختلف در تغییر عملکرد ژن را مورد مطالعه قرار داد. همچنین انتخاب به کمک این مارکرهای اختصاصی دارای کارآیی بیشتری نسبت به انتخاب بر اساس مارکرهای پیوسته با ژن می&shy;باشد.&nbsp; &nbsp;</strong></p> <p>There is a lot of information about genes sequence but their functions are still unknown. So, to fill the gap between structure and function of these sequences many reverse genetic researches have been done. Current experiment studying, how to design gene-specific primers, that can determine single nucleotide diversity and its impact on gene function.This research was condacted at International Center for Agricultural Research in the Dry Areas (ICARDA). Genes studied in present experiment include two genes responsible for salinity tolerance in barley, CBL4 and HvHKT1, in which eight primer pairs were designed. Primers efficiency for amplification of desired regions and demonstration of the single nucleotide variation was assessed through polymerase chain reaction and sequencing the fragments. All primers were designed with high function for amplification of genomic fragments and the associated single nucleotide diversity. These specific primers were designed from gene coding regions. They can therefore help to study nucleotide diversity between different genotypes and their roles in changes in gene function. Also, selection based on gene-specific markers would be more efficient than linked markers.</p> پرایمر اختصاصی ژن, تنوع تک نوکلئوتیدی, جو, CBL4, HvHKT1 Gene Specific Primer, Single nucleotide variation, Barley, CBL4 and HvHKT1 130 138 http://jcb.sanru.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1-143&slc_lang=fa&sid=1 راحله خادمیان 100319475328460010894 100319475328460010894 Yes دانشگاه بین المللی امام خمینی قزوین نادعلی بابائیان جلودار 100319475328460010895 100319475328460010895 No دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری سید محتبی خیام نکوئی 100319475328460010896 100319475328460010896 No پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی کرج محسن مردی 100319475328460010897 100319475328460010897 No پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی کرج بابک ناخدا 100319475328460010898 100319475328460010898 No پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی کرج