<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Journal of Crop Breeding</title>
<title_fa>پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی</title_fa>
<short_title>J Crop Breed</short_title>
<subject>Agriculture</subject>
<web_url>http://jcb.sanru.ac.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2228-6128</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2676-4628</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii></journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.61186/jcb</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid></journal_id_sid>
<journal_id_nlai></journal_id_nlai>
<journal_id_science></journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1395</year>
	<month>12</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2017</year>
	<month>3</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>8</volume>
<number>20</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>بررسی تنوع ژنتیکی و تجزیه ارتباط صفات فنولوژیک مرتبط با فرار از خشکی در لاین‌های جو با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره</title_fa>
	<title>Assessment of Genetic Diversity and Association Analysis for Phonological Traits Related to Drought Escape in Barley Lines using Microsatellite Markers</title>
	<subject_fa>اصلاح نباتات مولكولي </subject_fa>
	<subject>اصلاح نباتات مولكولي </subject>
	<content_type_fa>پژوهشي</content_type_fa>
	<content_type>Research</content_type>
	<abstract_fa>&lt;p dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;strong&gt;بررسی تنوع ژنتیکی گامی مهم در بهره&#8204;برداری از مواد گیاهی در برنامه&#8204;های به&#8204;نژادی است. در این مطالعه، تنوع ژنتیکی 55 لاین جو با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره مورد ارزیابی قرار گرفت و همچنین به&#8204;منظور شناسایی نشانگرهای مرتبط با صفات فنولوژیک و عملکرد مربوط به فرار از خشکی شامل صفات تعداد روز تا خوشه&#8204;دهی، طول دوره پر شدن دانه، تعداد روز تا رسیدگی فیزیولوژیک، وزن هزار دانه و عملکرد در لاین&#8204;های جو از نشانگرهای ریزماهواره استفاده شد. این صفات در شرایط دیم مورد ارزیابی قرار گرفتند. برای این منظور، از برگ&#8204;های جوان جو &lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;DNA&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt; استخراج گردید و محصولات تکثیری &lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt; با استفاده از 35 جفت آغازگر ریزماهواره روی ژل الکتروفورز واسرشته&#8204;ساز پلی&#8204;آکریلامید 5/4% بارگذاری شدند که 25 جفت آغازگر الگوی نواری واضح و چندشکل تولید کردند. در مجموع، 186 نوار چندشکل شناسایی گردید. تعداد نوارهای چندشکل مشاهده&amp;shy;شده از 2 تا 14 با میانگین 44/7 نوار به ازای هر جفت آغازگر متغیر بود. میزان اطلاعات چندشکلی برای آغازگرها از 18/0 تا 45/0 متغیر بود و میانگین آن 32/0 بود. لاین&#8204;های جو مورد مطالعه با استفاده از تجزیه خوشه&#8204;ای به 3 گروه تقسیم شدند، لاین&#8204;ها تا حد مطلوبی&lt;br&gt;
بر اساس منشاء جغرافیایی از یکدیگر تفکیک شدند که بیانگر کارایی نشانگرهای ریزماهواره در تشخیص تفاوت&#8204;ها و شباهت&#8204;های ژنتیکی می&#8204;باشد. همچنین، در تجزیه ارتباط 24 نشانگر مثبت شناسایی گردید. شناسایی نشانگرهای مثبت می&#8204;تواند در برنامه&#8204;های مکان&#8204;یابی ژن&#8204;های کنترل&#8204;کننده صفات فنولوژیک و عملکرد مرتبط با فرار از خشکی مورد استفاده قرار گیرد و شناسایی ژنوتیپ&amp;shy;های جو &amp;nbsp;فرارکننده از خشکی را تسهیل کرده و موجب صرفه&#8204;جویی در وقت، هزینه و نیروی انسانی گردد.&lt;/strong&gt;&lt;/p&gt;
</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p&gt;Assessment of genetic diversity is important step for exploitation from plant material in breeding programs. In this study, genetic diversity of 55 barley lines evaluated using SSR markers and also microsatellite markers were used to identify informative markers associated with phonological and yield traits related to drought escape including days to heading, grain filling period, days to physiological maturity, thousand kernel weight and grain yield. These traits were evaluated in rainfed conditions. In order to, DNA was extracted from young barley leaves and the PCR products by using 35 pair SSR primers were loaded on 4.5% denatured polyacrylamide gel that 25 pair primers produced clear and polymorphic banding pattern. In general, 186 polymorphic bands detected. The number of observed polymorphic bands varied from 2 to 14, with an average of 7.44 bands per pair primers. Polymorphic information content (PIC) for primers ranged from 0.18 to 0.45, with an average of 0.32. Studied barley lines divided to 3 groups by cluster analysis. Lines were relatively favorable separated according to geographical origin which presents the efficiency of microsatellite markers for the detection of genetic differences and similarity. Also, 24 Informative markers identified in association analysis. Detection of informative markers can be used in mapping of quantitative trait loci for phonological and yield traits related to drought escape and can facilitate the identification of drought-escaping barley genotypes and leads to saving time, expense and labor.&lt;/p&gt;
</abstract>
	<keyword_fa>تجزیه ارتباط, جو, تنوع ژنتیکی, نشانگرهای ریزماهواره و صفات فنولوژیک مرتبط با فرار از خشکی</keyword_fa>
	<keyword>Association analysis, Barley, Genetic diversity, Microsatellite markers and
                     Phonological traits related to drought escape
</keyword>
	<start_page>69</start_page>
	<end_page>60</end_page>
	<web_url>http://jcb.sanru.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-282-1&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Vahideh</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Gougerdchi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>وحیده</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>گوگردچی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>vahan1987@yahoo.com</email>
	<code>10031947532846005097</code>
	<orcid>10031947532846005097</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Former M. S student of Agriculture biotechnology, Payame Noor University, Alborz, Karaj</affiliation>
	<affiliation_fa>دانش‌آموخته کارشناسی ارشد مهندسی بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشگاه پیام نور کرج، البرز.</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Sara</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Dezhsetan</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سارا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>دژستان</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>sdezhsetan@gmail.com</email>
	<code>10031947532846005098</code>
	<orcid>10031947532846005098</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Genomics department; Agriculture biotechnology institute northwest and west (Tabriz), Agriculture Biotechnology Research Institute of Iran (ABRII). Assistant Professor, Department of Agronomy &amp; Plant Breeding, Faculty of Agricultural Science, University of Mohaghegh Ardabili, Ardabil.</affiliation>
	<affiliation_fa>بخش تحقیقات ژنومیکس، بیوتکنولوژی کشاورزی منطقه شمال‌غرب  و ‌غرب کشور (تبریز)، پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران (ABRII)؛ استادیار گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده علوم کشاورزی دانشگاه محقق اردبیلی.</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mahdi</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Izadi Dogonchi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مهدی</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>ایزدی دوگونچی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>m.izadi201040@yahoo.com</email>
	<code>10031947532846005099</code>
	<orcid>10031947532846005099</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Former M. S. student, Faculty of Agricultural Science, University of Mohaghegh Ardabili, Ardabil.</affiliation>
	<affiliation_fa>دانش‌اموخته کارشناسی ارشد زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده علوم کشاورزی دانشگاه محقق اردبیلی.</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mohammad Ali</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Ebrahimi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمد علی</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>ابراهیمی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>ma_ebrahimi@pnu.ac.ir</email>
	<code>10031947532846005100</code>
	<orcid>10031947532846005100</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Associate Professor, Department of Agricultural biotechnology, Payame Noor University, Tehran.</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشیار، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی دانشگاه پیام نور، تهران.</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Ali</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Asghari</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>علی</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>اصغری</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>ali_asgharii@yahoo.com</email>
	<code>10031947532846005101</code>
	<orcid>10031947532846005101</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Associate Professor, Department of Agronomy &amp; Plant Breeding, Faculty of Agricultural Science, University of Mohaghegh Ardabili, Ardabil.</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشیار گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده علوم کشاورزی دانشگاه محقق اردبیلی.</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Behzad</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Sadeghzadeh</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>بهزاد</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>صادق زاده</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>behzada4@yahoo.com</email>
	<code>10031947532846005102</code>
	<orcid>10031947532846005102</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Assistant Professor, Dryland Agricultural Research Institute (DARI), Maragheh,</affiliation>
	<affiliation_fa>استادیار موسسه تحقیقات کشاورزی دیم کشور (مراغه).</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
