<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Journal of Crop Breeding</title>
<title_fa>پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی</title_fa>
<short_title>J Crop Breed</short_title>
<subject>Agriculture</subject>
<web_url>http://jcb.sanru.ac.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2228-6128</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2676-4628</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii></journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.61186/jcb</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid></journal_id_sid>
<journal_id_nlai></journal_id_nlai>
<journal_id_science></journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1402</year>
	<month>7</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2023</year>
	<month>10</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>15</volume>
<number>47</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>غربالگری فنوتیپی و مولکولی ژنوتیپ‌های مختلف برنج بر اساس نشانگرهای مرتبط با صفت عطر</title_fa>
	<title>Phenotypic and Molecular Screening of Different Genotypes of Rice based on the Markers Related to the Aroma Trait</title>
	<subject_fa>بيوتكنولوژي گياهي </subject_fa>
	<subject>بيوتكنولوژي گياهي </subject>
	<content_type_fa>پژوهشي</content_type_fa>
	<content_type>Research</content_type>
	<abstract_fa>&lt;div style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsharp;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:2;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;b&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;چکیده مبسوط&lt;br&gt;
مقدمه و هدف:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/b&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt; کیفیت دانه یکی از اهداف بسیار مهم اصلاح برنج است. از صفات مهم در کیفیت دانه برنج، عطر آن است که حاصل بیان جهش&#8204;&amp;shy;های&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;مغلوب ژن&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt; OsBadh2 &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;بوده و ارزش اقتصادی برنج را تعیین می&amp;shy;کند. در این تحقیق به غربالگری فنوتیپی و مولکولی 50 ژنوتیپ مختلف برنج بر اساس نشانگرهای مرتبط با صفت عطر پرداخته شد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;b&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;مواد و روش&amp;shy;&#8204;ها:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/b&gt; &lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;در این پژوهش &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;50 ژنوتیپ محلی و اصـلاح شـده برنج از کلکسیون مؤسسه تحقیقات برنج کشور تهیه شده و &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;صفت عطر بر پایه ارزیابی بیوشیمیایی مرتبط با گزینش فنوتیپی بر اساس شدت عطر ایجاد شده در تیمار با محلول هیدروکسید پتاسیم 1/7 درصد و گزینش ژنوتیپی بر پایه الگوی باندی ایجاد شده حاصل از توالی ژنی تکثیر یافته با بکارگیری 3 جفت آغازگر اختصاصی (&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;Badh2&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;، &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;Badex7-5&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt; و &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;Nksbad2&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;) پیوسته با مکان&amp;shy;&#8204;های ژنی کنترل کننده صفت عطر انجام پذیرفت. &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;برای تحلیل همبستگی میان ژن&#8204;ها و فنوتیپ مشاهده شده، از مدل خطی تعمیم&#8204;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;&amp;shy;&amp;shy;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;یافته&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;رگرسیون لجستیک استفاده شد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;b&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;یافته&amp;shy;&#8204;ها:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/b&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt; بر اساس ارزیابی فنوتیپی، 31 رقم عطری و 19 رقم غیر عطری شناخته شدند که با داده&#8204;&amp;shy;های حاصل از غربالگری ژنوتیپی مطابقت کامل داشتند، &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;و مشخص گردید که &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;نشانگرهای &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;Badh&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt; و &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;Nkshad&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt; با اطمینان و دقت بسیار بالا &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;قادر به&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;پیش&amp;shy;بینی و متمایز کردن ارقام&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;عطری&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;و&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;غیر عطری هستند.&amp;nbsp; &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;b&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot; lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;نتیجه&#8204;گیری:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/b&gt;&amp;nbsp;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;نشانگرهای Badh2 و Nkshad2&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot; lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;می&amp;shy;&#8204;توانند&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span dir=&quot;RTL&quot; lang=&quot;FA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;بعنوان نشانگر کارآمد &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot; lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;در&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span dir=&quot;RTL&quot; lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;مکان&#8204;&amp;shy;یابی&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span dir=&quot;RTL&quot; lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;ژنی&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span dir=&quot;RTL&quot; lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;جمعیت&#8204;&amp;shy;های&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span dir=&quot;RTL&quot; lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;در&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span dir=&quot;RTL&quot; lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;حال&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span dir=&quot;RTL&quot; lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;تفرق&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span dir=&quot;RTL&quot; lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;برای&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span dir=&quot;RTL&quot; lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;عطر به&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;&amp;lrm;عنوان&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span dir=&quot;RTL&quot; lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;یک&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span dir=&quot;RTL&quot; lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;نشانگر&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span dir=&quot;RTL&quot; lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;همبارز&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span dir=&quot;RTL&quot; lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;به&#8204;جای &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot; lang=&quot;FA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;روش &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot; lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;ارزیابی فنوتیپی مورد استفاده قرار گیرند.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/div&gt;
&lt;span style=&quot;font-size:10pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;text-justify:inter-ideograph&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:80%&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span new=&quot;&quot; roman=&quot;&quot; style=&quot;font-family:&quot; times=&quot;&quot;&gt;&lt;b&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;font-size:8.0pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:80%&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/b&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;div style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:1;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;b&gt;&lt;span style=&quot;font-size:11.0pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;Extended Abstract&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/b&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-size:11pt&quot;&gt;&lt;b&gt;&lt;span new=&quot;&quot; roman=&quot;&quot; times=&quot;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;Introduction and Objective:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/b&gt;&lt;span new=&quot;&quot; roman=&quot;&quot; times=&quot;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt; Grain quality is one of the most important goals of rice breeding. One of the important traits in rice grain quality is its aroma, which is the result of the expression of recessive mutations of the OsBadh2 gene and determines the economic value of rice. In this research, the phenotypic and molecular screening of 50 different genotypes of rice was done based on the markers related to the aroma trait.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-size:11pt&quot;&gt;&lt;b&gt;&lt;span new=&quot;&quot; roman=&quot;&quot; times=&quot;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;Materials and Methods:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/b&gt; &lt;span new=&quot;&quot; roman=&quot;&quot; times=&quot;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;In this research, 50 local and improved genotypes of rice were prepared from the collection of the Rice Research Institute of Iran, and the aroma trait was based on biochemical evaluation related to phenotypic selection based on the intensity of the aroma created in the treatment with 1.7 potassium hydroxide solution percentage and genotypic selection were done based on the band pattern created from the amplified gene sequence by using 3 pairs of specific primers (Badh2, Badex7-5 and Nksbad2) contiguous with the gene locations controlling the scent trait. To analyze the correlation between genes and the observed phenotype, the generalized linear logistic regression model was used.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-size:11pt&quot;&gt;&lt;b&gt;&lt;span new=&quot;&quot; roman=&quot;&quot; times=&quot;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;Results:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/b&gt;&lt;span new=&quot;&quot; roman=&quot;&quot; times=&quot;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt; Based on phenotypic evaluation, 31 aromatic cultivars and 19 non-aromatic cultivars were identified, which were in full agreement with the data obtained from genotypic screening, and it was found that Badh2 and Nkshad2 markers are able to predict and distinguish aromatic and non-aromatic cultivars with high confidence and accuracy.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span 2=&quot;&quot; dir=&quot;RTL&quot; lang=&quot;AR-SA&quot; mitra=&quot;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;b&gt;&lt;span style=&quot;font-size:11.0pt&quot;&gt;&lt;span new=&quot;&quot; roman=&quot;&quot; times=&quot;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;Conclusion:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/b&gt;&lt;span style=&quot;font-size:11.0pt&quot;&gt;&lt;span new=&quot;&quot; roman=&quot;&quot; times=&quot;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt; Badh2 and Nksbad2 markers can be used as efficient markers in genetic localization of diverging populations for fragrance as a Codominant marker instead of a phenotypic evaluation method.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/div&gt;</abstract>
	<keyword_fa>ژنوتیپ برنج, صفت عطر, کیفیت دانه, غربالگری ژنتیکی</keyword_fa>
	<keyword>Aroma trait, Grain quality, Genetic screening, Rice genotype</keyword>
	<start_page>186</start_page>
	<end_page>194</end_page>
	<web_url>http://jcb.sanru.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1191-1&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Zeynab </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Yousefi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>زینب</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>یوسفی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>drzeynabyousefi@gmail.com</email>
	<code>100319475328460022742</code>
	<orcid>100319475328460022742</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Plant Production and Genetics, Faculty of Agriculture, University of Zanjan, Zanjan, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Khadijeh </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Bagheri </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>خدیجه</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>باقری</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>bagheri.khadijeh@znu.ac.ir</email>
	<code>100319475328460022743</code>
	<orcid>100319475328460022743</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Plant Production and Genetics, Faculty of Agriculture, University of Zanjan, Zanjan, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mostafa </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Modarresi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مصطفی</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>مدرسی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>m.modaresi@areeo.ac.ir</email>
	<code>100319475328460022744</code>
	<orcid>100319475328460022744</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>faculty member of Rice Research Institute of Iran, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Rasht, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>موسسه تحقیقات برنج کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، رشت، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Noraddin </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Hosseinpour Azad </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>نورالدین</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>حسین‌پور آزاد</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>n.hosseinpour@uma.ac.ir</email>
	<code>100319475328460022745</code>
	<orcid>100319475328460022745</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Plant Sciences and Medicinal Plants, Mashgin-Shahr Faculty of Agriculture, University Mohaghegh Ardabili, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>علوم گیاهی و گیاهان دارویی، دانشکده کشاورزی مشگین‌شهر، دانشگاه محقق اردبیلی، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
