fa بررسی عارضه اختلال در غلاف‌بندی سویا با رهیافت‌های پروتئومیک و بیوانفورماتیک بيوتكنولوژي گياهي بيوتكنولوژي گياهي پژوهشي Research <div style="text-align: justify;"><span style="font-size:14px;"><span style="line-height:2;"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span lang="FA"><span 2="" mitra="" style="font-family:">چکیده مبسوط</span></span></b></span></span></span><br> <span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span lang="FA"><span 2="" mitra="" style="font-family:">مقدمه و هدف:</span></span></b><span lang="FA"><span 2="" mitra="" style="font-family:"> عارضه اختلال در غلاف‌بندی نوع ویژه&shy;ای از رشد همراه با ناهنجاری در تشکیل گل و غلاف است که در آن گیاهان سویا مدت&shy;ها پس از رسیدگی غلاف &shy;ها، سبز باقی می&shy; مانند و منجر به کاهش شدید عملکرد می‌گردد. به منظور بررسی و شناسایی پروتئین‌های دخیل در تظاهر عارضه اختلال در غلاف‌بندی سویا، پروفایل بیان پروتئین &shy;های گیاهان سالم و مبتلا به عارضه اختلال در غلاف‌بندی سویا در دو رقم کتول و گرگان 3 بر اساس رهیافت‌های پروتئومیک و بیوانفورماتیک مورد مقایسه قرار گرفتند. </span></span></span></span></span><br> <span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span lang="FA"><span 2="" mitra="" style="font-family:">مواد و روش‌ها:</span></span></b><span lang="FA"><span 2="" mitra="" style="font-family:"> برای این منظور نمونه&shy; های برگی گیاهان سالم و مبتلا از دو رقم فوق در مرحله گلدهی انتخاب و پروتئین&shy; آنها به روش </span></span><span dir="LTR">TCA/Acetone</span><span lang="FA"><span 2="" mitra="" style="font-family:"> استخراج شد. سپس </span></span><span lang="AR-SA"><span 2="" mitra="" style="font-family:">تفکیک </span></span><span lang="FA"><span 2="" mitra="" style="font-family:">پروتئین &shy;ها و تجزیه افتراقی</span></span><span lang="AR-SA"><span 2="" mitra="" style="font-family:"> آنها به ترتیب</span></span><span lang="FA"><span 2="" mitra="" style="font-family:"> با استفاده</span></span><span lang="AR-SA"><span 2="" mitra="" style="font-family:"> از </span></span><span lang="FA"><span 2="" mitra="" style="font-family:">ژل الکتروفورز دو </span></span><span lang="AR-SA"><span 2="" mitra="" style="font-family:">بُعدی</span></span> <span lang="AR-SA"><span 2="" mitra="" style="font-family:">و طیف‌سنجی جرمی</span></span> <span dir="LTR">nESI-LC-MS/MS</span><span lang="FA"><span 2="" mitra="" style="font-family:"> انجام شد. </span></span></span></span></span><br> <span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span lang="FA"><span 2="" mitra="" style="font-family:">یافته‌ها:</span></span></b><span lang="FA"><span 2="" mitra="" style="font-family:"> تجزیه و تحلیل نتایج ژل الکتروفورز دو </span></span><span lang="AR-SA"><span 2="" mitra="" style="font-family:">بُعد</span></span><span lang="FA"><span 2="" mitra="" style="font-family:">ی نشان داد که سطح بیان 5 تا از 155 لکه پروتئینی در رقم کتول و 11 تا از 143 لکه پروتئینی در رقم گرگان 3 در گیاهان سالم و مبتلا به طور معنی&shy;داری تغییر یافت. آنالیز افتراقی پروتئین&shy; ها با تغییر بیان معنی &shy;دار با</span></span><span dir="LTR">nESI-LC-MS/MS </span>&nbsp;<span lang="FA"><span 2="" mitra="" style="font-family:">نشان داد که در پاسخ به این عارضه بیشتر پروتئین&shy; های درگیر در فعالیت &shy;های تنظیم سلولی، تولید انرژی، متابولیسم، انتقال سیگنال، نسخه&shy; برداری و ترجمه ژن و نیز تقسیط و ذخیره‌سازی پروتئین&shy;ها شرکت دارند. </span></span></span></span></span><br> <span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span lang="FA"><span 2="" mitra="" style="font-family:">نتیجه‌گیری:</span></span></b> <span lang="AR-SA"><span 2="" mitra="" style="font-family:">در میان پروتئین&shy; های شناسایی شده</span></span> <span lang="FA"><span 2="" mitra="" style="font-family:">احتمالا</span></span><span lang="AR-SA"><span 2="" mitra="" style="font-family:"> پروتئین&shy;های </span></span><span dir="LTR">14-3-3 like protein</span><span lang="FA"><span 2="" mitra="" style="font-family:">، </span></span><span dir="LTR">OEE2 </span><span lang="FA"><span 2="" mitra="" style="font-family:">، زیر واحد بزرگ رابیسکو و پروتئین </span></span><span dir="LTR">NACA</span><span lang="FA"><span 2="" mitra="" style="font-family:"> ممکن است از جمله تنظیم کننده&shy; های کلیدی عارضه اختلال در غلاف‌بندی سویا باشند.</span></span><span lang="FA"><span style="font-family:"2 Mitra""></span></span></span></span></span><br> <span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span lang="FA"><span style="font-family:"2 Mitra""></span></span></span></span></span></span></span><br> &nbsp;</div> <div style="text-align: justify;"><span style="font-size:12pt"><span style="line-height:90%"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span style="font-size:11.0pt"><span style="line-height:90%">Extended Abstract</span></span></b></span></span></span></span><br> <span style="font-size:12pt"><span style="line-height:90%"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span style="font-size:11.0pt"><span style="line-height:90%">Introduction and Objective:</span></span></b><span style="font-size:11.0pt"><span style="line-height:90%"> Pod distortion anomaly (PDA) is a particular type of growth along with flower and pod abnormality in that soybean plants remain green long after pod maturation which caused significantly yield reduction. To identification of proteins that involved in soybean pod distortion anomaly incidence, the proteins expression profiles of PDA and non-PDA soybean cultivars viz. Katul and Gorgan 3 were compared via proteomics and bioinformatics approaches.</span></span></span></span></span></span><br> <span style="font-size:12pt"><span style="line-height:90%"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span style="font-size:11.0pt"><span style="line-height:90%">Material and Methods:</span></span></b><span style="font-size:11.0pt"><span style="line-height:90%"> Therefore, leaf samples of two cultivars were collected at floweringgrowth stage and subjected to protein extraction using </span></span><span style="font-size:11.0pt"><span style="line-height:90%">TCA/acetone extraction method. Protein separation and </span></span><span style="font-size:11.0pt"><span style="line-height:90%">comparative analysis was performed</span></span><span style="font-size:11.0pt"><span style="line-height:90%"> using </span></span><span style="font-size:11.0pt"><span style="line-height:90%">two-dimensional gel electrophoresis and nESI-LC-MS/MS mass spectrometery, respectively.</span></span></span></span></span></span><br> <span style="font-size:12pt"><span style="line-height:90%"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span style="font-size:11.0pt"><span style="line-height:90%">Results:</span></span></b><span style="font-size:11.0pt"><span style="line-height:90%"> The 2-DE analysis revealed that 5 out of 155 protein spots in Katul and 11 out of 143 protein spots in Gorgan 3 had significantly different expression levels in PDA and non-PDA plants. The differential analysis of significantly expressed spots by nESI-LC-MS/MS showed that most of these protein had already been discovered to regulate cellular activities as diverse as energy production, metabolism, signal transduction, gene transcription and translation as well as </span></span><span style="font-size:11.0pt"><span style="line-height:90%">protein destination and storage.</span></span></span></span></span></span><br> <span style="font-size:12pt"><span style="line-height:90%"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span style="font-size:11.0pt"><span style="line-height:90%">Conclusion:</span></span></b><span style="font-size:11.0pt"><span style="line-height:90%"> Taken together, it is possible that <span style="background:white">14-3-3 like protein, OEE2</span></span></span><span style="font-size:11.0pt"><span style="background:white"><span style="line-height:90%">, </span></span></span><span style="font-size:11.0pt"><span style="background:white"><span style="line-height:90%">ribulose 1, 5 bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunite and NACA proteins are among the most important regulators of&nbsp; pod distortion anomaly incidence.&nbsp; </span></span></span><span style="font-size:11.0pt"><span style="line-height:90%"></span></span></span></span></span></span></div> <span style="font-size:12pt"><span style="line-height:90%"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span style="font-size:11.0pt"><span style="line-height:90%"></span></span></span></span></span></span><br> &nbsp; پروتئوم سویا, پروتئولیز سلولی, رابیسکو, ژل الکتروفورز دو بُعدی, طیف‌سنجی جرمی, فنوتیپ سبز Cell proteolysis, Green-stay phenotype, Mass spectrometery, Rubisco, Soybean proteome, Two dimentional gel electrophoresis 127 137 http://jcb.sanru.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1068-1&slc_lang=fa&sid=1 Kamal Payghamzadeh کمال پیغام‌زاده k.peyghamzade@areeo.ac.ir 100319475328460018991 100319475328460018991 Yes Agricultural Research, Education and Extension Organization بخش تحقیقات علوم زراعی-باغی، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان گلستان، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، گرگان، ایران Mahmood Toorchi محمود تورچی mtoorchi@tabrizu.ac.ir 100319475328460018992 100319475328460018992 No University of Tabriz گروه اصلاح و بیوتکنولوژی گیاهی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران Zahra Sadat Shobbar زهرا سادات شبر shobbar@abrii.ac.ir 100319475328460018993 100319475328460018993 No Agricultural Research, Education and Extension Organization موسسه تحقیقات بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران