Journal of Crop Breeding

fa تجزیه ارتباطی صفات آگروموفولوژیک در لاین‌های ذرت با استفاده از نشانگرهای مبتنی بر رتروترنسپوزون IRAP و REMAP Association Analysis of Agromorphological Traits in Maize Lines using Retrotransposon Based Markers IRAP and REMAP اصلاح نباتات مولكولي اصلاح نباتات مولكولي پژوهشي Research <div style="text-align: justify;">ذرت (Zea mays L.) یکی از مهمترین محصولات غذایی در سراسر جهان بوده و به عنوان گیاه مدل برای مطالعه ژنتیک صفات مختلف استفاده می شود. شناسایی مکانهای ژنی کنترل کننده صفات کمّی از موضوعهای مهم حوزه ژنتیک و به نژادی است. در این مطالعه 100 لاین خالص ذرت از لحاظ صفات آگرومورفولوژیک (ارتفاع بوته، ارتفاع بوته تا اولین بلال، طول و عرض برگ، سطح برگ، شاخص سطح برگ، تعداد بلال، میزان کلروفیل، وزن دانه‌ در هر بوته، وزن چوب بلال، قطر ابتدای چوب بلال، قطر وسط چوب بلال، طول چوب بلال، وزن خشک بوته، تاریخ ظهور گل نر، تاریخ ظهور بلال اول و تاریخ ظهور بلال دوم) با طرح پایه کاملاً تصادفی با شش تکرار ارزیابی شدند. در آزمایش مولکولی پروفیل مولکولی لاین ها با هشت آغازگر نشانگرهای مبتنی بر رتروترنسپوزون؛ IRAP و REMAP تهیه شد. هشت ترکیب آغازگر IRAP وREMAP  40 مکان ژنی را تکثیر کردند. از این 40 مکان، 38 مکان ژنی (95 درصد) چندشکلی نشان دادند. دامنه ‌PIC در لاین‌های مورد مطالعه از 0/084 برای نشانگر Ac/Ds تا 0/383 برای نشانگر Pangrangja متغیر بود. فاصله ژنتیکی نی بین لاینهای تهیه شده از مشهد و کرمانشاه 0/053، کرج و مشهد 0/036، کرمانشاه و کرج 0/032 برآورد شد. در تجزیه ساختار جمعیت بر اساس نشانگرهای مولکولی، 100 لاین مورد مطالعه در دو زیر جمعیت (K=2) گروهبندی شدند. در تجزیه ارتباطی صفات اگرو-مورفولوژیک براساس دو روش GLM و MLM به ترتیب 24 و 12 ارتباط نشانگر-صفت شناسایی شد. در این تحقیق دو نشانگر مشترک Heartbraker (480) در صفات قطر ابتدای چوب بلال و طول چوب بلال وUBC878 × Ruda در صفات تعداد بلال و وزن دانه هم با مدل خطی عمومی و هم با مدل خطی مخلوط شناسایی شد. نتایج بدست آمده از این مطالعه، اطلاعات ارزشمندی در زمینه گزینش به کمک نشانگر و مبنای ژنتیکی صفات مورد مطالعه ارائه می دهد که می‌توان از این اطلاعات در گزینش افراد طی برنامه‌های به نژادی و تولید ارقام جدید با میزان عملکرد بالا بهره برد.</div> <div style="text-align: justify;">Maize (Zea mays L.) is one of the most important food crops worldwide and is widely used as genetic research material for studying various traits. Identification of genetic loci controlling quantitative trait is an important subject in genetics and breeding programs. In the present study, 102 maize inbred lines was evaluated for agro-morphological traits (plant height, plant height until first ear, leaf length, leaf width, leaf surface, leaf area indexear number, chlorophyll content, grain weight per plant, cob’s dry weight, cob’s diameter in first part, cob’s diameter in middle part, cob’s length, plant dry weight, days to tassel emergence, days to first ear emergence, days to second ear emergence) in completely randomized design with six replications. In the molecular experiment, 8 retrotransposon-based molecular markers primers was used for preparing the molecular profile of lines. Eight IRAP and REMAP primer combinations amplified 40 gene loci. Thirty-eight out of 40 loci (95%) showed polymorphism. The PIC values in the studied lines ranged from 0.084 for Ac/Ds to 0.383 for Pangrangja marker. The Nei’s genetic distance between lines prepared from Mashhad and Kermanshah was 0.053, between lines from Karaj and Mashhad was 0.036 and between lines from Kermanshah and Karaj was 0.032. In the analysis of population structure based on molecular markers, 102 studied lines were grouped into two subpopulations (K = 2). In the association analysis of agro-morphological traits based on two GLM and MLM methods, 24 and 12 marker-trait relationships were identified, respectively. In this study, two commons markers; Heartbraker (480) in cob’s diameter in first part and cob’s length and UBC878 × Ruda in ear number and grain weight per plant were identified with both general linear and mixed linear models. This information can be used in selecting individuals during tobacco breeding programs and developing varieties with high yield and performance.</div> تجزیه ارتباطی, تنوع ژنتیکی, ذرت, ساختار جمعیت, عدم تعادل پیوستگی, نشانگرهای آگاهی بخش Association analysis, Genetic diversity, Informative markers, Linkage disequilibrium, Maize, Population structure 10 24 http://jcb.sanru.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-313-12&slc_lang=fa&sid=1 Sanaz Khalifani ساناز خلیفانی shahnazkhalifani.2015@gmail.com 100319475328460015928 100319475328460015928 No Urmia University گروه تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه ارومیه، ارومیه Ali Ghaffari Azar علی غفاری آذر alighaffariazar@gmail.com 100319475328460015929 100319475328460015929 No Urmia University گروه تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه ارومیه، ارومیه Reza Darvishzadeh رضا درویش زاده r.darvishzadeh@urmia.ac.ir 100319475328460015930 100319475328460015930 Yes Urmia University گروه تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه ارومیه، ارومیه، استاد پژوهشکده زیست‌فناوری دانشگاه ارومیه، ارومیه، Danial Kahrizi دانیال کهریزی dkahrizi@yahoo.com 100319475328460015931 100319475328460015931 No Razi University, Kermanshah گروه تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه رازی، کرمانشاه Hadi Alipour هادی علیپور alipourhadi64@gmail.com 100319475328460015932 100319475328460015932 No Urmia University گروه تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه ارومیه، ارومیه