<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Journal of Crop Breeding</title>
<title_fa>پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی</title_fa>
<short_title>J Crop Breed</short_title>
<subject>Agriculture</subject>
<web_url>http://jcb.sanru.ac.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2228-6128</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2676-4628</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii></journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.61186/jcb</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid></journal_id_sid>
<journal_id_nlai></journal_id_nlai>
<journal_id_science></journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1398</year>
	<month>9</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2019</year>
	<month>12</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>11</volume>
<number>32</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>شناسایی، جداسازی و تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی پیشبر اختصاصی غده گیاهان</title_fa>
	<title>Identification, isolation and bioinformatics analysis of specific tuber promoter in plants</title>
	<subject_fa>بيوتكنولوژي گياهي </subject_fa>
	<subject>بيوتكنولوژي گياهي </subject>
	<content_type_fa>پژوهشي</content_type_fa>
	<content_type>Research</content_type>
	<abstract_fa>&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:2  mitra;&quot;&gt;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp; بررسی حاضر با هدف شناسایی پیشبر مناسب برای اندام غده گیاهی در سال 1397 در دانشگاه شهید بهشتی انجام شد. بدین &amp;shy;منظور ابتدا توالی&amp;shy; های مربوط به پیشبر گیاهان غده&#8204;ای مختلف در سایت &lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;NCBI&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; &lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:2  mitra;&quot;&gt;جستجو شد. توالی&amp;shy; ها هم ردیف شدند و آغازگرهای هدف از نقاط محافظت &amp;shy;شده طراحی شدند. تجزیه و تحلیل نتایج &lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:2  mitra;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;، &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:2  mitra;&quot;&gt;حضور پیشبر موردنظر را در گیاهان سیب&#8204;زمینی شیرین و تارو تایید کرد. در ادامه، به&amp;shy; منظور تایید بیشتر، تجزیه و تحلیل&#8204;های بیوانفورماتیکی شامل تعیین عناصر سیس، فاکتورهای رونویسی و عملکرد آن&#8204;ها، فاکتورهای رونویسی با بیان بالا و پایین صورت گرفت. در نهایت پیشبر پیش&amp;shy;بینی&#8204;شده با پیشبر کلاس یک پاتاتین از لحاظ عناصر سیس و عملکرد مقایسه شد. نتایج تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی نشان داد پیشبر موردنظر دارای عناصر سیس عمومی و اختصاصی می&amp;shy; باشد. عناصر سیس عمومی در اغلب پیشبرها وجود دارد و در فعال &amp;shy;سازی و تنظیم پیشبر، فرآیندهای سلولی، فرآیندهای نموی و تحمل تنش&#8204;های زیستی و غیرزیستی نقش دارند.&amp;nbsp; عناصر سیس اختصاصی غده، در بیان پروتئین&#8204;های ذخیره&#8204;ای و نشاسته فعال می&#8204;باشد. مقایسه بین پیشبر مورد مطالعه و پیشبر اختصاصی غده پاتاتین، تاییدی بر فعالیت پیشبر مورد مطالعه در غده بود. پیشبر غده، در آینده می&amp;shy;تواند برای بیان پروتئین&amp;shy; های مختلف در غده&#8204; گیاهان استفاده شود.&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;br&gt;
&lt;br&gt;
&lt;br&gt;
&amp;nbsp;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p style=&quot;text-align:justify&quot;&gt;&amp;nbsp; &amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;In this study, in order to find the suitable tuber promoter, an experiment was conducted in Shahid Beheshti University in 2018. For this purpose, promoter sequences of different tuberous plants were searched at NCBI. Sequences were multiple-aligned and the target primers designed from conserved regions. PCR analysis confirmed the presence of the desired promoter in plants of sweet potato and taro. In order to further confirmation, bioinformatic analysis including identification of cis elements, transcription factors, their function, transcription factors with high and low expression were performed. Finally, the identified promoter was compared with patatin class 1 promoter in terms of cis elements and function. Results of bioinformatic analysis indicated that the promoter has specific and general cis elements. General cis elements that are present in most promoters and are involved in activation and regulation of promoters, cellular processes, developmental processes and tolerance to biological and non-biological stresses. Special cis elements of tuber are active in expression of storage protein and starch. Comparison between studied promoter and specific tuber promoter of patatin confirms activity of the studied promoter in the tuber. A tuber promoter can be used to express various proteins in tuber plants in the future.&lt;br&gt;
&amp;nbsp;&lt;/p&gt;</abstract>
	<keyword_fa>پاتاتین, تارو, سیب‌زمینی‌شیرین, عناصر سیس و فاکتورهای رونویسی.</keyword_fa>
	<keyword>Cis Elements, Patatin, Sweet Potato, Taro, Transcription Factor</keyword>
	<start_page>1</start_page>
	<end_page>10</end_page>
	<web_url>http://jcb.sanru.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-67-2&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>rahele</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>ghanbari moheb seraj</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>راحله</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>قنبری محب سراج</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>r.ghanbary6565@gmail.com</email>
	<code>100319475328460012361</code>
	<orcid>100319475328460012361</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>University of Mohaghegh Ardabili</affiliation>
	<affiliation_fa>رشته بیوتکنولوژی و ژنتیک مولکولی گیاهی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه محقق اردبیلی</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>masoud</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>tohidfar</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مسعود</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>توحیدفر</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>gtohidfar@yahoo.com</email>
	<code>100319475328460012362</code>
	<orcid>100319475328460012362</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>shahid beheshti university</affiliation>
	<affiliation_fa>عضو هیئت علمی، دانشیار، گروه بیوتکنولوژی، دانشکده علوم و فناوری زیستی، دانشگاه شهید بهشتی</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
