TY - JOUR T1 - Screening of Rice (Oryza sativa L.) Alloplasmic Lines Via RAPD Molecular Markers TT - غربالگری لاین‌های آلوپلاسمیک برنج (Oryza sativa L.) با استفاده از نشانگر مولکولی RAPD JF - jcb JO - jcb VL - 1 IS - 2 UR - http://jcb.sanru.ac.ir/article-1-145-fa.html Y1 - 2009 SP - 43 EP - 54 N2 - در سیستم سه لاینی تولید بذر هیبرید برنج، بخش اعظمی از ناخالصی ژنتیکی در مرحله تکثیر و نگهداری لاین‌های نر عقیم سیتوپلاسمی (CMS) صورت می‌گیرد، در نتیجه بذور لاین‌های CMS با بذور لاین‌های نگهدارنده (B) اختلاط می‌یابند. در این راستا انگشت‌نگاری لاین‌های اصلاحی و شناسایی نشانگرهای اختصاصی، پیش زمینه آزمون خلوص ژنتیکی این لاین‌ها است. بدین منظور شش لاین نر عقیم سیتوپلاسمی شامل ندا A، نعمت A، دشت A، چمپا A، آمل3 A و IR58025A به همراه شش لاین نگهدارنده باروری با استفاده از 25 آغازگر RAPD مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند. به دلیل زمینه ژنتیکـی مشابه لاین‌های CMS و نگهدارنده، لاین‌های ایزوژن در اکثر مکان‌های نشانگری از الگوی باندی یکسانی برخوردار بودند. در این پژوهش تنها در مورد آغازگرهای OPH20 و OPH01 به ترتیب قطعه 950 و 850 نوکلئوتیدی شناسایی گردیدند که قادر به تمایز لاین‌های CMS و لاین‌های B از یکدیگر می‌باشند یعنی لاین‌های C‏MS دارای باندهای اختصاصی بوده، در حالی که لاین‌های نگهدارنده فاقد قطعه مذبور می‌باشند. جهت بررسی ماهیت هسته‌ای یا سیتوپلاسمی بودن این باندها، قطعه OPH20-950 bp از لاین‌های ندا A و IR58025A جداسازی و با استفاده از سیستم T/A در باکتری Escherichia coli سویه DH5 همسانه‌سازی و نهایتاً تعیین ترادف گردیدند. آنالیزهای همردیفی قطعه مورد نظر با توالی موجود در بانک ژن، نشان‌دهنده همولوژی 95 درصدی با توالی ژنوم میتوکندریایی بود. تحقیقا از نتایج این مطالعه می‌توان در شناسایی و بررسی خلوص ژنتیکی لاین‌های CMS (نوع WA) استفاده نمود. M3 ER -