RT - Journal Article T1 - Identification of Up-regulated Transcripts in Salt Tolerant Rice (Oryza sativa L.) Cultivar using the cDNA-AFLP Technique JF - jcb YR - 2017 JO - jcb VO - 9 IS - 23 UR - http://jcb.sanru.ac.ir/article-1-880-fa.html SP - 125 EP - 137 K1 - CDNA-AFLP K1 - Gene expression K1 - Oryza sativa K1 - Salt stress K1 - Transcript AB - تنش شوری یکی از مهم­ترین تنش­های غیرزیستی برای برنج است که به­طور منفی رشد و باروری آن را متأثر می­سازد. در این پژوهش اثرات تنش شوری بر بیان افتراقی برخی از ژن­های مسئول در تنش شوری در دو ژنوتیپ برنج متحمل و حساس به شوری (FL478 و IR29) با استفاده از تکنیک cDNA-AFLP مورد بررسی قرار گرفت. از میان TDFهای (Transcript Derived Fragments یا قطعات حاصل از رونوشت­ها) حاصل از 2 آنزیم برشی و 18 ترکیب آغازگری که در پاسخ به تنش شوری در رقم مقاوم در مقایسه با تیمار شاهد و حساس افزایش بیان نشان داده بودند 28 TDF جدا شد که در نهایت 21 عدد از آن­ها کلون، توالی­یابی و در بانک ژن ثبت گردیدند و سپس با استفاده از الگوریتم بلاست مورد آنالیز قرار گرفتند. TDFهای شناسایی شده در این مطالعه متعلق به گروه­های متفاوتی از ژن­ها شامل متابولیسم، ترارسانی سیگنال، فاکتورهای رونویسی، سمیت­زدایی، سیستم ترانسپورت و دیگر مکانیسم­های مرتبط با تنش شوری بودند که این امر بیانگر آن است که تعداد زیادی از فرآیندها در پاسخ به تنش شوری درگیر هستند. سپس تعدادی از این ژن­ها برای تأئید الگوهای بیانی به دست آمده توسط cDNA-AFLP با استفاده از آنالیز Real time PCR انتخاب گردیدند که نتایج به دست آمده از این آزمایش الگوهای بیانی ردیابی شده با استفاده از تکنیک cDNA-AFLP را تأئید نمود. نتایج این تحقیق نشان داد که cDNA-AFLP تکنیک قدرتمندی برای بررسی الگوی بیان ژن­های برنج تحت تنش شوری می­باشد. علاوه بر این یافته­های ما به روشن نمودن اساس مولکولی اثرات تنش شوری بر ژنوم برنج و شناسایی ژن­هایی که می­توانند تحمل به شوری برنج را افزایش دهند کمک می­نماید. LA eng UL http://jcb.sanru.ac.ir/article-1-880-fa.html M3 10.29252/jcb.9.23.125 ER -