دوره 8، شماره 18 - ( تابستان 1395 )                   جلد 8 شماره 18 صفحات 126-133 | برگشت به فهرست نسخه ها

XML English Abstract Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Association Analysis of AFLP and RAPD Markers With Cadmium Accumulation in Wheat. jcb. 2016; 8 (18) :126-133
URL: http://jcb.sanru.ac.ir/article-1-648-fa.html
صارمی راد بابک، شکرپور مجید، سفالیان امید، هاشمی نژاد سیده الهه، آوانس آرمن، اسفندیاری عزت‌اله. تجزیه ارتباطی تجمع کادمیم در گندم با استفاده از نشانگرهای AFLP و RAPD. پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی. 1395; 8 (18) :126-133

URL: http://jcb.sanru.ac.ir/article-1-648-fa.html


دانش آموخته کارشناسی ارشد
چکیده:   (573 مشاهده)

کادمیم عنصری سمی و غیر ضروری برای انسان و گیاه است که به راحتی از طریق گیاهان جذب می‌شود. وجود تنوع ژنتیکی در ارتباط با تجمع کادمیم امکان استفاده از روش‌های اصلاحی برای گزینش ژنوتیپ‌هایی با میزان تجمع کم کادمیم را فراهم می‌آورد. با توجه به هزینه زیاد تجزیه بافت‌های گیاهی برای تعیین میزان کادمیم، استفاده از نشانگرها برای کمک به گزینش ژنوتیپ‌هایی با تجمع کم کادمیم روش موثری به شمار می‌آید. از این رو به منظور بررسی کارایی نشانگرهای AFLP و RAPD در شناسایی و تعیین خصوصیات مربوط به تجمع کادمیم در گندم، آزمایشی با دو سطح کادمیم شامل صفر (شاهد) و 25/0 میلی‌مولار و 43 ژنوتیپ گندم انجام گردید. در تجزیه AFLP با استفاده از شش ترکیب آغازگردر مجموع 328 نوار با میانگین 66/54 نوار به‌ ازای هر ترکیب آغازگر تولید شد که از این تعداد، 207 نوار دارای چندشکلی بود. در تجزیه RAPD تعداد شش آغازگر از 50 آغازگر ارزیابی شده با الگوی نواری مناسب برای بررسی تمام ژنوتیپ‌ها استفاده شد. این آغازگرها در مجموع 31 نوار چند شکل با 16/5 نوار به ازای هر آغازگر تولید کردند. رابطه بین داده‌های مولکولی و صفات مورد اندازه‌گیری از طریق تحلیل رگرسیون چندگانه مورد بررسی قرار گرفت. در مجموع 113 نشانگر آگاهی‌بخش در سطح شاهد و 77 نشانگر آگاهی‌بخش در سطح 25/0 میلی‌مولار کادمیم شناسایی شد. تعدادی از نشانگرها با بیش از یک صفت رابطه معنی‌دار داشتند. نتایج این تحقیق درتأمین اطلاعات اولیه برای انتخاب غیرمستقیم صفات از طریق نشانگرهای مرتبط مفید می‌باشد.

واژه‌های کلیدی: کادمیم، گندم، نشانگر، AFLP، RAPD
متن کامل [PDF 698 kb]   (313 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: اصلاح نباتات

فهرست منابع
1. Asgari A. 2006. Genetic relationships of Iranian maize inbred germplasm using microsatellite markers and identification of informative markers for important agronomic traits. M.Sc. Thesis in agricultural biotechnology, Faculty of agriculture, University of Tabriz, Tabriz, Iran. 292 pp (In Persian).
2. Ci, D., D. Jiang, B. Wollenweber, T. Dai, Q. Jing and W. Cao. 2010. Genetic variance in cadmium tolerance and accumulation in wheat materials differing in ploidy and genome at seedling stage. Journal of Agronomy and Crop Science, 196: 302-310. [DOI:10.1111/j.1439-037X.2010.00417.x]
3. Clemins, S., M.G. Palmgren and U. Krämer. 2002. A long way ahead: understanding and engineering plant metal accumulation. Trends in Plant Science, 7: 309-315. [DOI:10.1016/S1360-1385(02)02295-1]
4. Esfandiari, E., M. Shokrpour and S. Alavi-Kia. 2010. Effect of Mg deficiency on antioxidant enzymes activities and lipid peroxidation. Journal of Agricultural Science, 3: 131-136. [DOI:10.5539/jas.v2n3p131]
5. Gray, C.W., R.G. McLaren and A.H.C. Roberts. 2001. Cadmium concentration insome New Zealand wheat grain. New Zealand Journal of Crop and Horticultural Science, 29: 125-136. [DOI:10.1080/01140671.2001.9514170]
6. Greger, M. and M. Lofstedt. 2004. Comparison of uptake and distribution of cadmium in different cultivars of bread and durum wheat. Crop Science, 44: 501-507 [DOI:10.2135/cropsci2004.5010]
7. Hamza, S., W.B. Hamida, A. Rebai and M. Harrabi. 2004. SSR-Based genetic diversity assessment among Tunisian winter barley and relationship with morphological traits. Euphytica, 135: 107-118. [DOI:10.1023/B:EUPH.0000009547.65808.bf]
8. Harris, N.S. and G.J. Taylor. 2004. Cadmium uptake and translocation in seedlings of near isogenic lines of durum wheat that differ in grain cadmium accumulation. Plant Biology, 4: 1-12.
9. Ibrahimi, A., M. Naghavi, M. Sabokdast and A. Moradi. 2011. Association analysis with microsatellite markers for agronomic traits in Iranian native barlies. Modern Genetics Journal, 6: 35-43 (In Persian).
10. Mane, A.V., R. Sankpal and S. Ambawade. 2010. Cadmium chloride induced alteration in growth and cadmium accumulation in Triticum aestivum. Pharmaceutical Chemistry Journal, 5: 206-215.
11. Naghavi, M.R., M. Mardi, S.M. Pirseyedi, M. Kazemi, P. Potki and M.R. Ghaffari, 2007. Comparison ofgenetic variation among accessions of Aegilops tauschiiusing AFLP and SSR markers. Genetic Resources and Crop Evolution, 54: 237-240. [DOI:10.1007/s10722-006-9143-z]
12. Penner, G.A., J. Clarke, L.J. Bezte and D. Leisle. 1995. Identification of RAPD markers linked to a gene governing cadmium uptake in durum wheat. Genome, 38: 543-547. [DOI:10.1139/g95-070]
13. Rashidi, S., M. Mardi, A. Hosseinzadeh and M. Naghavi. 2008. Association analysis between main agronomic traits and SSAP retrotransposon markers in durum wheat. Modern Genetics Journal, 3: 29-35 (In Persian).
14. Roy, J.K., R. Bandopadhyay, S. Rustgi, H.S. Balyan and P.K. Gupta. 2006. Association analysis of agronomically important traits using SSR, SAMPL and AFLP markers in bread wheat. Current Science, 90: 683-694.
15. Saghai-Maroof, M.A., K.M. Soliman, R.A. Jorgensen and R.W. Allard. 1984. Ribosomal DNA spacer-length polymorphisms in barley: mendelian inheritance chromosomal location, population dynamics. Proceedings of the Nationa Academy of Sciences of the United States of America, 81: 8014-8018. [DOI:10.1073/pnas.81.24.8014]
16. Saremi Rad, B., E. Esfandiari, M. Shokrpour, O. Sofalian, A. Avanes and S.B. Mousavi. Cadmium effects on some morphological and physiological parameters in wheat at seedling stage. Iranian Journal of Biology, 27: 1-11 (In Persian).
17. Shayiq, F. 2005. Evaluation of genetic diversity in winter canola cultivars using DNA markers. M.Sc. thesis in agricultural biotechnology, Faculty of agriculture, University of Tabriz, Tabriz, Iran. 316 pp (In Persian).
18. Shokrpour, M., S.A. Mohammadi, M. Moghaddam, S.A. Ziai and A. Javanshir. 2008. Analysis of morphologic association, phytochemical and AFLP markers in milk thistle (Silybium marianum L.). Iranian Journal of Medical and Aromatic Plants, 24: 278-292 (In Persian).
19. Stolt, J.P., F.E.C. Sneller, T. Bryngelsson, T. Lundbor and H. Schat. 2003. Phytochelatin and cadmium accumulation in wheat. Environmental and Experimental Botany, 49: 21-28. [DOI:10.1016/S0098-8472(02)00045-X]
20. Tanhuanpää, P., R. Kalendar, A.H. Schulman and E. Kiviharju. 2007. A major gene for grain cadmium accumulation in oat (Avena sativa L.). Genome, 50: 588-594. [DOI:10.1139/G07-036]
21. Virk, P.S., B.V. Ford-Lioyd, M.T. Jackson, H.S. Pooni, T.P. Clemeno and H.J. Newbury. 1996. Marker-assisted prediction of agronomic traits using diverse rice germplasm. IRRI, Rice genetics III, Proceedings of The Third International Rice Genetics Symposium, 307-316.
22. Vos, P., R. Hogers, M. Bleeker, M. Reijans, D.L. Theovan and M. Hornes. 1995. AFLP: A new technique for DNA frigerprinting. Nucleic Acids Research, 23: 4407-4414. [DOI:10.1093/nar/23.21.4407]

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
کد امنیتی را در کادر بنویسید

کلیه حقوق این وب سایت متعلق به پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

© 2015 All Rights Reserved | Journal of Crop Breeding

Designed & Developed by : Yektaweb